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Enregistrement W4413374925 · doi:10.3897/phytokeys.261.151948

Reinstatement of Hellwigia Warb. (Zingiberaceae) and its molecular and morphological delimitation

2025· article· en· W4413374925 sur OpenAlexafffund
Seni Kurnia Senjaya, Axel Dalberg Poulsen, Quentin Cronk

Notice bibliographique

RevuePhytoKeys · 2025
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueGinger and Zingiberaceae research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLembaga Pengelola Dana PendidikanTorben og Alice Frimodts FondCarlsbergfondetFairchild Tropical Botanic GardenCompute Canada
Mots-clésCladeBiologyMonophylyNdhFPolyphylyGenusTaxonLineage (genetic)ZoologyInternal transcribed spacerEvolutionary biologyBotanyPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The currently polyphyletic genus Alpinia Roxb. (Zingiberaceae) has over 260 species widely spread through subtropical and tropical Asia and a complex taxonomic history. This study focuses on the “Carolinensis” clade of Alpinia hitherto suggested by molecular evidence. We expand on previous research through more comprehensive taxon sampling (about a fivefold increase) and morphological observation. We inferred maximum likelihood (ML) and Bayesian trees based on the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region, using sequences available on GenBank along with 70 newly generated sequences from this study. Our main findings are as follows: (1) ITS provides a convenient marker for separating members of this clade from other Alpinieae . (2) Phylogenetic reconstruction strongly supports the monophyly of the Carolinensis clade. (3) We identify four subclades with relatively distinct geographical distributions. (4) We determine that morphologically the clade is characterized by inflorescences having densely packed flowers arranged on lateral monochasial cymes, tubular bracteoles, and flowers with oblong or linear labella. (5) The clade is apparently restricted to the east of Huxley’s biogeographic line. These findings support the recognition of the Carolinensis clade as a distinct genus. Hellwigia Warb. is the oldest valid name for this lineage, and till the present paper only includes H. pulchra Warb. We present a generic circumscription of the genus comprising 76 species to date placed in Alpinia . In the present paper, we make 76 new combinations and designate 26 lectotypes. The eastern distribution of the clade offers insights into historical biogeographic barriers and lineage diversification. As such, Hellwigia represents an interesting model for exploring evolutionary and ecological processes in this region, and future phylogenomic studies will be critical for resolving remaining phylogenetic uncertainties and for deepening our understanding of the evolutionary dynamics in this unique lineage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,471
Écart entre enseignants0,359 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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