Rewiring of Transcription Factor Binding: Another Piece of the Intricate Puzzle of IBD Pathogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Whatever stimuli come from the global environment (the exposome), being they exogenous like microbial, dietary, and chemical ones, or endogenous, like genetic, metabolic, biochemical, and physical ones, the body reacts by setting in motion an intricate cascade of cellular, molecular, and signaling events that culminate with gene regulation (activation or suppression) and the transcription-mediated production of bioactive molecules. These events occur both in physiological as well as pathological conditions, and represent fundamental steps that maintain health or mediate disease. Each of these steps is multifactorial, complex, and biologically indispensable, but this commentary will discuss primarily the regulation of gene expression and the consequences for inflammatory bowel disease (IBD). The pathogenesis of IBD is highly complex on its own and is currently believed to result from the integration of environmental, genomic, microbial, and immune factors. As a chronic inflammatory condition, it is easy to envision that a multitude of genes are deregulated in IBD at both the systemic and intestinal level, but it is still unclear which are the primary or secondary drivers of this modulation, and which ones actually mediate disease. However, regardless of the primary or secondary nature of the gene modulation process, the basic steps and components involved in this process are basically the same. Unfortunately, the investigation of these steps has been relatively limited in IBD, particularly in regard to upstream events, as the vast majority of studies have been focused on downstream events and how to block the resulting pro-inflammatory products for justifiable therapeutic purposes. This focused but skewed approach to IBD has left large gaps in our understanding of the molecular underpinnings of ulcerative colitis (UC) and Crohn’s disease (CD), and particularly the factors that regulate and control gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».