Whole-Genome Sequence Analysis of <i>Magnaporthe oryzae</i> Strain RB20
Notice bibliographique
Résumé
Magnaporthe oryzae is a key model species for studying the evolution of phytopathogens and host adaptation due to its efficient virulence assays, genomic flexibility, and genetic tractability. In this study, we present a high-quality, chromosome-level genome assembly of the M. oryzae strain RB20, which provides key insights into its pathogenicity. The 45.60-Mb genome, assembled into 7 chromosomes with 99.7% BUSCO completeness, encodes 500 predicted effector proteins and 977 CAZymes, including virulence-associated chitinases implicated in host-pathogen interactions. Comparative genomic analysis revealed numerous structural variations between RB20 and other widely used strains 70-15, Guy11, and P131, primarily characterized by extensive repeat contractions, tandem expansions, large-scale deletions (>50 kb), and megabase-level repeat expansions. These genomic alterations are likely responsible for the observed differences in pathogenicity. Our findings provide valuable resources for advancing the understanding of M. oryzae evolution and for developing targeted strategies to control rice blast disease. [Formula: see text] Copyright © 2025 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».