Co‐phylogenetic constraints on host breadth within an emerging fungal pathogen complex of global concern
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Emerging fungal infectious diseases constitute the largest pathogen threat to plants. However, the factors influencing fungal‐plant interactions, host shifts, and the emergence of pathogens on a novel host are still not well understood. Evolutionary relationships among hosts appear to be important, with closely related hosts often sharing pathogens and pests, but we typically lack information on the evolutionary history of the pathogens. Here, we gather over 27,000 sequences to construct a comprehensive phylogenetic tree for Botryosphaeriaceae, a fungal family including many emerging pathogens of global concern, and explore the evolutionary conservatism in fungal‐plant associations across host and pathogen phylogenies. We reveal a significant influence of both phylogenies in constraining fungal‐plant associations. However, we also show that most fungal pathogens are generalists, able to infect multiple hosts, and demonstrate an evolutionary trend toward increased generalism, contrary to theory that suggests that pathogens should evolve toward increased host specialization. We suggest that the anthropogenic movement of plant species and agricultural practices might have allowed some Botryosphaeriaceae to escape phylogenetic constraints on host range via increasing the ecological opportunities for host shifts. Understanding the factors influencing fungal‐plant interaction and host breadth of pathogenic fungi could help identify emerging threats, prevent spillover onto naïve plants, and reduce the risk of further host range expansion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».