MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4413812423 · doi:10.1016/j.immuni.2025.08.001

Anchored screening identifies transcription factor blueprints underlying dendritic cell diversity and subset-specific anti-tumor immunity

2025· article· en· W4413812423 sur OpenAlexaff
Luís Henriques‐Oliveira, Abigail Altman, Ilia Kurochkin, Ervin Ascic, Evelyn Halitzki, Diogo Pértiga-Cabral, Isabel Ulmert, Signe Holst, M. Nair, Pedro P. Cunha, Sun‐Mi Park, Stefano Vergani, Michael G. Kharas, Joan Yuan, Katharina Lahl, Fábio F. Rosa, Cristiana F. Pires, Carlos‐Filipe Pereira

Notice bibliographique

RevueImmunity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilUniversity at BuffaloHorizon 2020 Framework ProgrammeNovo Nordisk FondenRegion SkåneVetenskapsrådetScience for Life LaboratoryLund University Medical Faculty FoundationH2020 European Research CouncilCancerfondenEuropean CommissionKnut och Alice Wallenbergs StiftelseLunds UniversitetFundação para a Ciência e a TecnologiaFrancis Crick InstituteCancer Research Institute
Mots-clésBiologyTranscription factorImmunityDiversity (politics)Dendritic cellBlueprintImmunologyCancer researchGeneticsImmune systemGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transcription factor cooperation is essential for specifying the heterogeneous dendritic cell (DC) lineages that orchestrate adaptive immunity, yet how it drives subset diversification remains poorly understood. Here, we employed a sequential anchored screen of 70 transcription factors using direct cellular reprogramming to identify regulators that specify type 2 conventional DCs (cDC2s) and plasmacytoid DCs (pDCs). We identified PU.1, IRF4, and PRDM1 as inducers of a pro-inflammatory cDC2B-like fate and SPIB, IRF8, and IKZF2 as mediators of an immature lymphoid DC program. Transcriptomic profiling linked these triads to lineage-specific signatures and demonstrated their requirement for subset identity. Mechanistically, lineage divergence was driven by chromatin co-engagement at subset-specific sites early in reprogramming. Functionally, reprogrammed DCs employed distinct immune mechanisms to elicit orthogonal anti-tumor responses in different tumor models. Collectively, our findings uncover transcriptional circuits that control DC diversification and pave the way to generate patient-tailored DC subsets for cancer immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,622
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueImmunityMême sujetImmunotherapy and Immune ResponsesTravaux en français237 207