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Enregistrement W4413900232 · doi:10.1002/elps.70018

Characterization of the Specific Binding Between Aptamers and Cytochrome <i>c</i> With Pressure‐Assisted Capillary Electrophoresis Frontal Analysis

2025· article· en· W4413900232 sur OpenAlexafffund
Shuanghao Wang, Chunliang Li, Shuangshuang Wang, Huihui Li, David D. Y. Chen

Notice bibliographique

RevueElectrophoresis · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAptamerCapillary electrophoresisCytochrome cChemistryBinding constantElectrophoresisBiophysicsBiomoleculeBinding siteChromatographyBiochemistryMolecular biologyBiologyApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Cytochrome c (cyt c ) is a heme protein located in the mitochondrial intermembrane space. Because the release of cyt c is a highly specific event in apoptotic signaling, it can serve as an apoptosis‐related marker. To date, three frequently used aptamers for cyt c (Apt40, Apt61, and Apt76) have been selected and applied in the field of sensing. The response of these aptamers is not clear, partly because of their weak affinity and nonspecific binding inherent to the system. In this study, pressure‐assisted capillary electrophoresis frontal analysis (PACE‐FA) was used to characterize the interactions between the aptamers and cyt c , and an electrophoretic mobility‐based correction was introduced to obtain accurate binding constants. A nonlinear curve‐fitting approach was used for evaluating specific binding interactions in the presence of nonspecific binding. Apt76 was found to bind specifically to cyt c , exhibiting the highest binding constant (1.53 × 10 6 M −1 ), and all three aptamers interacted with cyt c at 1:1 stoichiometry. Fluorescence titrations were performed to verify the effectiveness of the reference‐free PACE‐FA method. This study demonstrates that specific binding between biomolecules has different characteristics compared to nonspecific binding and that the PACE‐FA method can be widely used in the evaluation of biological macromolecular interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,646

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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