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Enregistrement W4413960438 · doi:10.1101/2025.09.02.673847

SH2-mediated steric occlusion of the C2 domain regulates autoinhibition of SHIP1 inositol 5-phosphatase

2025· preprint· en· W4413960438 sur OpenAlexaff
Emma E. Drew, Hunter G. Nyvall, Matthew AH Parson, Reed K. Talus, John E. Burke, Scott D. Hansen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésSteric effectsPhosphataseChemistryInositolCell biologyDomain (mathematical analysis)BiochemistryBiophysicsPhosphorylationStereochemistryBiologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Src homology 2 (SH2) domain containing inositol polyphosphate 5-phosphatase 1 (SHIP1) is an immune cell specific enzyme that regulates phosphatidylinositol-(3,4,5)-trisphosphate signaling at the plasma membrane following receptor activation. SHIP1 plays an important role in processes such as directed cell migration, endocytosis, and cortical membrane oscillations. Alterations in SHIP1 expression have been shown to perturb myeloid cell chemotaxis and differentiation. In the brain, SHIP1 regulate microglial cell behaviors, which has been linked to Alzheimer's disease. Understanding the structural and functional relationships of SHIP1 is critical for developing ways to modulate SHIP1 membrane localization and lipid phosphatase activity during immune cell signaling. Recently, we discovered that the N-terminal SH2 domain of SHIP1 suppresses lipid phosphatase activity. SHIP1 autoinhibition can be relieved through interactions with receptor-derived phosphotyrosine (pY) peptides presented on membranes or in solution. Using hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) we identified intramolecular contacts between the N-terminal SH2 domain and CBL1 motif of the C2 domain that limit SHIP1 membrane localization and activity. Single molecule measurements of purified SHIP1 on supported lipid bilayers and in neutrophil-like cells support a model in which the SH2 domain blocks membrane binding of the central catalytic module. Mutations that disrupt autoinhibition enhance the membrane binding frequency and increase the catalytic efficiency of SHIP1. Although dimerization of SHIP1 enhances membrane localization and the apparent phosphatase activity, it is not required for SHIP1 autoinhibition. Overall, our results provide new insight concerning SHIP1's structural organization, membrane binding dynamics, and the mechanism of autoinhibition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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