Variation in the molecular phenotype of βglu1, an insect defense-related beta-glucosidase gene, in two transcontinental Picea species
Notice bibliographique
Résumé
Forest trees face threats from many insect pest species, underscoring the importance of understanding their defense mechanisms for survival. In a North American conifer species Picea glauca, white spruce, a defense-related gene, βglu1, is responsible for releasing phenolic compounds (acetophenones) to defend against its insect defoliator, Choristoneura fumiferana, the eastern spruce budworm. βglu1 is also expressed in a Eurasian conifer species Picea abies, Norway spruce, although no major insect defoliator is present within the species’ natural range. We compared range-wide variation of βglu1 transcript levels from foliage samples of P. glauca in North America and P. abies in Europe using RT-qPCR and targeted transcriptome sequencing. βglu1 transcript levels were highly correlated between the two methods, with wide ranges of variation being detected within and between populations in both species. We found a significant longitudinal gradient in βglu1 transcript levels in P. glauca, with one βglu1 gene form being differentially expressed across populations, but not in P. abies. The expression level differences in P. glauca are consistent with the historically higher C. fumiferana outbreak frequency and severity in eastern compared to western populations, with C. fumiferana defoliation severity being a significant explanatory variable for βglu1 transcript levels. Climate per se was not a significant explanatory factor in either species. Overall, these results enhance our understanding of potential adaptive variation in acetophenone defenses in P. glauca, while the factors influencing βglu1 transcript variation in P. abies require further investigation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».