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Enregistrement W4414005941 · doi:10.1101/2025.09.03.25334761

ci-fGBD: Cluster-Integrated Fast Generalized Bruhat Decomposition for Multimodal Data Clustering in Alzheimer's Disease.

2025· preprint· en· W4414005941 sur OpenAlexafffund
Lokendra Thakur, Gurpreet Bharj, Lokesh Sangabattula, Bushra Malik

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierIndian Institute of Technology DelhiNorthern California Institute for Research and EducationPfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationEli Lilly and CompanyFoundation for the National Institutes of HealthBioClinicaMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeEisaiAlzheimer's AssociationCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésCluster analysisCluster (spacecraft)DecompositionDiseaseComputer scienceArtificial intelligenceMedicineChemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multimodal biomedical datasets, such as those from neurodegenerative disease cohorts, present significant challenges in stratifying heterogeneous patient populations due to missing values, high dimensionality, and modality-specific biases. Traditional clustering methods often require extensive preprocessing and fail to integrate heterogeneous data types effectively. We introduce ci-fGBD(Cluster-Integrated Fast Generalized Bruhat Decomposition), a novel matrix factorization and clustering framework that natively operates on block-structured, multimodal datasets. ci-fGBD extends the classical Bruhat decomposition by jointly learning latent representations and patient clusters while automatically harmonizing contributions across diverse modalities, including neuroimaging, cognitive assessments, genomics, wearable sensors, and environmental exposures. Benchmarking against standard methods on real datasets demonstrates that ci-fGBD consistently identifies clinically meaningful subgroups, capturing subtle biological, cognitive, and demographic heterogeneity in Alzheimer disease cohorts with superior interpretability and robustness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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