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Enregistrement W4414019364 · doi:10.1080/19490976.2025.2546998

Metabolomics reveal distinct molecular pathways associated with future risk of Crohn’s Disease

2025· article· en· W4414019364 sur OpenAlexafffundabout
Mingyue Xue, Sun-Ho Lee, Jingchen Shao, Haim Leibovitzh, H Huynh, Anne M. Griffiths, Dan Turner, Karen Madsen, Paul Moayyedi, A. Hillary Steinhart, Mark S. Silverberg, Colette Deslandres, Alain Bitton, David R. Mack, Kevan Jacobson, Mark J. Ropeleski, Maria Cino, Guy Aumais, Çharles N. Bernstein, Remo Panaccione, Brian Bressler, Osvaldo Espin‐Garcia, Wei Xu, Williams Turpin, Kenneth Croitoru

Notice bibliographique

RevueGut Microbes · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensPublic Health OntarioSt. Paul's HospitalUniversity of ManitobaQueen's UniversityBC Children's HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of OttawaMcGill University Health CentreCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversity of British ColumbiaUniversity Health NetworkHealth Sciences CentreOntario College of Art and DesignHospital for Sick ChildrenUniversité de MontréalUniversity of AlbertaUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of CalgaryMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesTemerty Faculty of Medicine, University of TorontoCanadian Institutes of Health ResearchLeonard M. Miller School of MedicineCrohn's and Colitis CanadaHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoUniversity of AlbertaLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustDalhousie UniversityMax Rady College of Medicine, University of ManitobaBC Children's HospitalQueen's UniversityHebrew University of JerusalemMcMaster UniversityMcGill University Health CentreMcGill UniversityCincinnati Children's Hospital Medical CenterGovernment of OntarioFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaUniversity of Miami
Mots-clésBiologyMetabolomicsCrohn's diseaseDiseaseComputational biologyBioinformaticsGeneticsInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Host - microbiome interactions are central to Crohn'sdisease (CD) pathogenesis; yet the early metabolic alterations that precededisease onset remain poorly defined. To explore preclinical metabolicsignatures of CD, we analyzed baseline serum metabolomic profiles in a nestedcase-control study within the Crohn's and Colitis Canada - Genetics, Environment, Microbiome (CCC-GEM) Project, a prospective cohort of 5,122 healthyfirst-degree relatives (FDRs) of CD patients. We included 78 individuals wholater developed CD and 311 matched FDRs who remained disease-free. In an untargetedassessment of metabolomic data, we identified 63 metabolites significantlyassociated with future CD risk. Integrative analyses further identifiedmultiple associations between CD-related metabolites and proteomic markers, gutmicrobiome composition, antimicrobial antibody, fecal calprotectin andC-reactive protein. Quinolinate, a tryptophan catabolite, was elevated inindividuals who later developed CD and showed strong positive correlations withC-reactive protein, fecal calprotectin, and C-X-C motif chemokine ligand 9 (CXCL9).In contrast, higher levels of ascorbate and isocitrate were associated withreduced CD risk and were negatively correlated with C-reactive protein and CD-associated proteins.These findings identify several distinct molecular pathways that contribute toCD pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,790
Score d'incertitude au seuil0,819

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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