Metabolomics reveal distinct molecular pathways associated with future risk of Crohn’s Disease
Notice bibliographique
Résumé
Host - microbiome interactions are central to Crohn'sdisease (CD) pathogenesis; yet the early metabolic alterations that precededisease onset remain poorly defined. To explore preclinical metabolicsignatures of CD, we analyzed baseline serum metabolomic profiles in a nestedcase-control study within the Crohn's and Colitis Canada - Genetics, Environment, Microbiome (CCC-GEM) Project, a prospective cohort of 5,122 healthyfirst-degree relatives (FDRs) of CD patients. We included 78 individuals wholater developed CD and 311 matched FDRs who remained disease-free. In an untargetedassessment of metabolomic data, we identified 63 metabolites significantlyassociated with future CD risk. Integrative analyses further identifiedmultiple associations between CD-related metabolites and proteomic markers, gutmicrobiome composition, antimicrobial antibody, fecal calprotectin andC-reactive protein. Quinolinate, a tryptophan catabolite, was elevated inindividuals who later developed CD and showed strong positive correlations withC-reactive protein, fecal calprotectin, and C-X-C motif chemokine ligand 9 (CXCL9).In contrast, higher levels of ascorbate and isocitrate were associated withreduced CD risk and were negatively correlated with C-reactive protein and CD-associated proteins.These findings identify several distinct molecular pathways that contribute toCD pathogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».