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Enregistrement W4414024234 · doi:10.1101/2025.09.02.673885

Isolation-free Identification and Phenotyping of First-Trimester Extravillous Trophoblasts Residing in Cervical Fluid

2025· preprint· en· W4414024234 sur OpenAlexaff
Manpreet Kalkat, Kevin D. Pavelko, Michael Strausbach, Austin Goodyke, Lauren C. Crimp, Dennis K. Lee, D. Randall Armant, Sascha Drewlo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and preeclampsia studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsolation (microbiology)Identification (biology)First trimesterPregnancySecond trimesterMedicineBiologyObstetricsBioinformaticsFetusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Preeclampsia (PE) remains difficult to predict, particularly when it manifests late in gestation. To capture early placental signals, we profiled trophoblast cells sampled from the cervix in the first trimester using mass cytometry (CyTOF). We established protocols for clinical sample storage and applied spike-in reference control cells to deliver reproducible, batch-corrected protein measurements, thereby advancing CyTOF from a discovery tool to a translational platform. Within HLA-G⁺CD45⁻ cells, we identified canonical CK7⁺ extravillous trophoblasts, as well as a previously unrecognized CK7⁻subset, and both subsets expressed placental proteins. Expression of PAPP-A, GAL-13, and GAL-14 was significantly altered in a pilot cohort of pregnancies that subsequently developed late-onset PE, distinguishing cases from controls at both single-marker and multivariate levels. These findings reveal unexpected trophoblast heterogeneity, demonstrate that placental alterations are detectable before the development of late-onset PE, and establish cervical trophoblast profiling as a promising platform for scalable biomarker discovery and first-trimester risk assessment in placenta-mediated disorders. Impact Statement First-trimester trophoblasts sampled from the cervix reveal early molecular changes associated with late-onset preeclampsia, while an isolation-free, reference-normalized CyTOF workflow establishes a scalable, clinically compatible platform for biomarker discovery and multicenter-ready early risk assessment in pregnancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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