Nasal cells as a bronchial cell surrogate for pre-clinical assessment of drug response in cystic fibrosis
Notice bibliographique
Résumé
Patient-derived airway cell cultures are used in personalized medicine strategies for people with cystic fibrosis (pwCF) to predict potential clinical response to cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) modulator drugs. While bronchial epithelial cells from lung explants (HBEx) are the gold standard for CFTR functional measurements, nasal epithelial cells (HNE) are a more practical tissue source resulting in widespread use for preclinical functional platforms. HNE have so far not been rigorously validated against the gold standard for this purpose. In this study, we collected nasal and bronchial cells, and lung explants from pwCF undergoing lung transplantation as well as non-CF controls. Comparative studies in non-CF cells showed that while CFTR-mediated transepithelial currents in HNE underestimated those in HBEx, the magnitude of the CFTR modulator response was similar between CF HNE, brushed HBE (HBEb), and HBEx with significant correlation between matched HNE and HBEb from 16 pwCF. These findings confirm use of HNE as surrogate of bronchial airway for preclinical drug testing with report of drug responses in relation to the tissue-specific non-CF or baseline controls rather than as absolute results. Furthermore, CF centres offering HNE-based drug testing utilize different techniques, challenging the comparison of results between centres. We show how culture media, use of fresh or freeze-thawed cells as well as difference in Ussing technique impact the magnitude of measured CFTR function, which is why we suggest diligence in reporting of these factors when presenting CFTR modulator drug response results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».