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Enregistrement W4414051486 · doi:10.1182/bloodadvances.2024015427

The lncRNA <i>ELDR</i> suppresses tumorigenicity of AML by interfering with DNA replication and chromatin accessibility

2025· article· en· W4414051486 sur OpenAlexafffund
Kaifee Arman, Julie A. Ross, Eva-Maria Piskor, Luca Lazzari, Virginie Calderon, Gaspard Reulet, María Vera, E Hilaire, Hugo Würtele, Brian T. Wilhelm, Tarik Möröy

Notice bibliographique

RevueBlood Advances · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensInstitut de Readaptation Gingras Lindsay de MontrealInstitute for Research in Immunology and CancerMcGill UniversityUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChromatinDNA replicationMyeloid leukemiaDemethylaseChromatin immunoprecipitationReplication factor CProliferating cell nuclear antigenSmall interfering RNATranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT: Acute myeloid leukemia (AML) with rearrangement of the mixed lineage leukemia gene expresses MLL-AF9 fusion protein, a transcription factor that impairs differentiation and drives expansion of leukemic cells. In this work, the zinc finger protein "growth factor independent 1" together with the histone methyltransferase LSD1 is revealed to occupy the promoter and regulate the expression of the lncRNA ELDR (EGFR [epidermal growth factor receptor] long non-coding downstream RNA) in the rearranged Mixed Lineage Leukemia (MLL) (MLL-r) AML cell line THP-1. Forced ELDR overexpression enhanced the growth inhibition of an Lysine-Specific Demethylase 1 inhibitor (LSD1i)/all-trans retinoic acid (ATRA) combination treatment and reduced the capacity of these cells to generate leukemia in xenografts, leading to a longer leukemia-free survival. ELDR is found to bind the clamp protein Proliferating Cell Nuclear Antigen (PCNA) and the MCM5 helicases causing defects of DNA replication fork progression. Moreover, AML cells overexpressing ELDR had reduced chromatin accessibility and transcription at α-satellite repeats in centromeres. In addition, ELDR RNA was detected close to MLL-AF9 at centromeres suggesting that it impedes leukemic progression preferentially of MLL-r AML by interfering with both DNA replication and centromeric transcription. Our findings reveal novel functions of the lncRNA ELDR in DNA replication and centromere biology when expressed at high levels in AML cells with MLL rearrangements. These discoveries could provide rationale for future strategies to treat MLL-r AML, which has a poor prognosis in children and adults. Delivery of the ELDR RNA could potentially be used as an adjunct to LSD1i/ATRA treatment or other currently used chemotherapeutic drugs to develop novel therapies for these AML subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,240
Score d'incertitude au seuil0,272

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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