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Enregistrement W4414060626 · doi:10.7554/elife.108253.1

SLC4A1 mutations that cause distal renal tubular acidosis alter cytoplasmic pH and cellular autophagy

2025· preprint· en· W4414060626 sur OpenAlexaff
Grace Essuman, Midhat Rizvi, Ensaf Y. Almomani, Sayyed Hanif Ullah, Sarder MA Hasib, Forough Chelangarimiyandoab, Priyanka Mungara, Manfred Schmitt, Marguerite Hureaux, Rosa Vargas‐Poussou, Nicolas Touret, Emmanuelle Cordat

Notice bibliographique

RevueeLife · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntercalated CellAutophagyDistal renal tubular acidosisIntracellularCytosolBAG3MutantV-ATPaseIntracellular pH

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Distal renal tubular acidosis (dRTA) is a disorder characterized by the inability of the collecting duct system to secrete acids during metabolic acidosis. The pathophysiology of dominant or recessive SLC4A1 variant related dRTA has been linked with the mis trafficking defect of mutant kAE1 protein. However, in vivo studies in kAE1 R607H dRTA mice and humans have revealed a complex pathophysiology implicating a loss of kAE1-expressing intercalated cells and intracellular relocation of the H+-ATPase in the remaining type-A intercalated cells. These cells also displayed accumulation of ubiquitin and p62 autophagy markers. The highly active transport properties of collecting duct cells require the maintenance of cellular energy and homeostasis, a process dependent on intracellular pH. Therefore, we hypothesized that the expression of dRTA variants affect intracellular pH and autophagy pathways. In this study, we report the characterization of newly identified dRTA variants and provide evidence of abnormal autophagy and degradative pathways in mouse inner medullary collecting duct cells and kidneys from mice expressing kAE1 R607H dRTA mutant protein. We show that reduced transport activity of the kAE1 variants correlated with increased cytosolic pH, reduced ATP synthesis, attenuated downstream autophagic pathways pertaining to the fusion of autophagosomes and lysosomes and/or lysosomal degradative activity. Our study elucidated a close relationship between the expression of defective kAE1 proteins, reduced mitochondrial activity and decreased autophagy and protein degradative flux.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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