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Enregistrement W4414126122 · doi:10.17221/6/2025-pps

Characterisation of strawberry mild yellow edge virus isolates detected for the first time in Poland

2025· article· en· W4414126122 sur OpenAlexaboutno aff
M. Cieślińska, Ewa E. Hennig

Notice bibliographique

RevuePlant Protection Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogenetic treeRecombinationStrain (injury)Coat proteinVirusSequence analysisPlant virusGenePhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV) was detected in 116 samples out of 423 collected from strawberry plants grown in commercial and experimental plantations in seven provinces of Poland. The number of samples infected with strawberry mottle virus (SMoV) accounted for 84.6% of the 26 SMYEV-positive samples selected for sequence analysis. The nucleotide sequence similarity of the coat protein (CP) gene of 26 selected SMYEV isolates ranged from 84.8% to 100%, and 81.4–99.5% identity was found between these isolates and 48 SMYEV strains from different countries. The CP region's phylogenetic analysis showed that most isolates from Poland clustered within group I (type D74). In contrast, Talis and 3233CL isolates represented group III (type MY18), and the San isolate was clustered in group V (type ABY1-01). Recombination analysis of the CP gene sequences detected two possible recombination events. One was noticed in the Argentinian strain 53, which formed group III with isolates from Chile, and Polish isolates Talis and 3233CL. Another was identified in the Chinese strain sy02 sequence with evidence of the same recombination event in Canadian strains, and the Polish isolate San (V group). Leaf epinasty, mottling, and yellowing of the young leaves and dieback of the older leaves were observed on 'Alpine' and 'EMC' indicator plants grafted with leaves of strawberry plants co-infected with SMYEV and SMoV. A single infection with SMYEV induced milder symptoms based on these indicators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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