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Enregistrement W4414162578 · doi:10.1371/journal.pgen.1011842

Genome-wide association study provides novel insight into the genetic architecture of severe obesity

2025· article· en· W4414162578 sur OpenAlexaff
Mohanraj Krishnan, Mohammad Yaser Anwar, Anne E. Justice, Geetha Chittoor, Hung‐Hsin Chen, Rashedeh Roshani, Alyssa Scartozzi, R. Dickerson, Roelof A. J. Smit, Michael H Preuss, Nathalie Chami, Benjamin S Hadad, Esteban J. Parra, Miguel Cruz, Qin Hui, Peter W F Wilson, Yan V. Sun, Xiaoyu Zhang, Gregorio V. Linchangco, Sharon L. R. Kardia, Jessica D. Faul, David R. Weir, Lawrence F. Bielak, Heather M. Highland, Kristin L. Young, Baiyu Qi, Yujie Wang, Myriam Fornage, Christopher Haiman, Iona Cheng, Ulrike Peters, Charles Kooperberg, Steven Buyske, Joseph B. McCormick, Susan P. Fisher‐Hoch, Frida Lona‐Durazo, Jesús Peralta, Jamie Gomez-Zamudio, Stephen S. Rich, Kendra Ferrier, Ethan M. Lange, Christopher R. Gignoux, Eimear E. Kenny, Genevieve L. Wojcik, Kelly Cho, Michael Gaziano, Luc Djoussé, Shuwei Liu, Dhananjay Vaidya, Renée de Mutsert, Navya Shilpa Josyula, Chr. Bauer, Wei Zhao, Ryan W. Walker, Jennifer A. Smith, Leslie A. Lange, Mariah Meyer, Ching‐Ti Liu, Lisa R. Yanek, Miryoung Lee, Laura M. Raffield, Ruth J. F. Loos, Penny Gordon‐Larsen, Jennifer E Below, Kari E North, Mariaelisa Graff

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMontreal Heart InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDivision of Diabetes, Endocrinology, and Metabolic DiseasesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNHLBI Division of Intramural ResearchNorth Carolina Translational and Clinical Sciences Institute, University of North Carolina at Chapel HillNational Human Genome Research InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesPediatric Scientist Development ProgramNational Cancer InstituteNational Institute on AgingNational Eye InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Child Health and Human DevelopmentU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésGenetic architectureObesityPhenomeGenetic associationBody mass indexGenome-wide association studyGenetic predispositionMechanism (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe obesity (SevO) is a primary driver of cardiovascular diseases (CVD), cardiometabolic diseases (CMD) and several cancers, with a disproportionate impact on marginalized populations. SevO is an understudied global health disease, limiting knowledge about its mechanisms and impacts. In genome-wide association study (GWAS) meta-analyses of the tail end of the BMI distribution (≥95th percentile BMI) and two SevO phenotypes [Obesity Class III BMI ≥ 40 kg/m2 and Obesity Class IV BMI ≥ 50 kg/m2] in 159,359 individuals across eleven ancestrally diverse population-based studies followed by replication in 480,897 individuals across six ancestrally diverse studies, we identified and replicated three novel signals in known loci of BMI [TENM2, PLCL2, ZNF184], associated with SevO traits. We confirmed a large overlap in the genetic architecture of continuous BMI and severe obesity phenotypes, suggesting little genetic heterogeneity in common variants, between obesity subgroups. Systematic analyses combining functional mapping, polygenic risk scores (PRS), phenome wide association studies (PheWAS) and environmental risk factors further reinforce shared downstream comorbidities associated with continuous measures of BMI and the importance of known lifestyle factors in interaction with genetic predisposition to SevO. Our study expands the number of SevO signals, demonstrates a strong overlap in the genetic architecture of SevO and BMI and reveals a remarkable impact of SevO on the clinical phenome, affording new opportunities for clinical prevention and mechanistic insights.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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