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Enregistrement W4414219196 · doi:10.1002/anse.202500077

Solution‐Based Biophysical Methods for Guiding Design of Aptamers into Electrochemical Biosensors

2025· article· en· W4414219196 sur OpenAlexafffund
Minh‐Dat Nguyen, Sofia Mittelstedt, Philip E. Johnson, Philippe Dauphin‐Ducharme

Notice bibliographique

RevueAnalysis & Sensing · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensYork UniversityUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAptamerContext (archaeology)BiosensorFolding (DSP implementation)Isothermal titration calorimetrySequence (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Structure‐switching aptamers are utilized in various applications and have increasingly been translated into electrochemical biosensors, largely thanks to post‐SELEX sequence engineering through computational and enzymatic approaches. In the context of sequence engineering, it is envisioned that folding and binding thermodynamics could likewise contribute to accelerating translation of aptamers into sensors. Herein, this is explored by first characterizing a series of quinine‐binding aptamers using the biophysical methods isothermal titration calorimetry and nano differential scanning calorimetry. The folding and binding thermodynamics obtained are compared with the resulting analytical performance when aptamers are adapted into sensors. The findings show that the magnitude of sensor response is strongly correlated with aspects of the binding and unfolding thermodynamics of the aptamer as measured in solution. Using a similar approach, a recently reported adenosine monophosphate aptamer is successfully engineered to support electrochemical sensing. It is envisioned that relying on solution‐based biophysical methods will further improve post‐SELEX sequence engineering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,445
Score d'incertitude au seuil0,850

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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