Surface sampling for mpox virus in multiple healthcare settings in Sierra Leone, June 2025
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Background As mpox virus (MPXV) has continued to expand geographically, critical knowledge gaps in environmental persistence in resource-limited healthcare settings remain. Despite evidence of fomite-mediated transmission, no empirical data exist on surface contamination in West African hospitals during active mpox outbreaks. Methods In this cross-sectional study, we conducted a systematic environmental surveillance study at two major hospitals in Sierra Leone (Connaught Hospital, Freetown; Bo Government Hospital, Bo) during peak transmission (June 2025). A total of 89 high-contact surfaces were sampled across clinical and non-clinical zones using standardized protocols. MPXV DNA was extracted via robotic MagMax protocols and detected through quantitative real-time PCR targeting the B6R gene. Results Overall, 13.5% (12/89) of surfaces tested positive by PCR for MPXV, with geographic variation: Freetown (14.0%, 7/50) vs. Bo (12.8%, 5/39). Cycle threshold values (32.34–39.86) indicated low-to-moderate viral genomes. Critical contamination hotspots were identified, with doors representing 42% (5/12) of positive samples; predominantly ward entrances, staff offices, and bathrooms. Patient beds and clinical instruments constituted secondary risk zones (8.3% each). Conclusions This first-in-region study demonstrates quantifiable MPXV genomes from surfaces in Sierra Leonean healthcare facilities, providing support for patients with mpox, highlighting areas for infection prevention and control (IPC) considerations. The predominance of doors as high-risk fomites underscores the need for targeted disinfection protocols. Our findings establish environmental surveillance as a vital component of mpox control in clinical settings and provide evidence for IPC resource prioritization, including enhanced disinfection of high-touch surfaces and integration of IPC monitoring into national outbreak response frameworks.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».