MERS-CoV and SARS-CoV-2 infection in diverse human lung organoid-derived cultures
Notice bibliographique
Résumé
Cell cultures are widely used to study infectious respiratory diseases and to test therapeutics; however, they do not faithfully recapitulate the architecture and complexity of the human respiratory tract. Lung organoids have emerged as an alternative model that partially overcomes this key disadvantage. Lung organoids can be cultured in various formats that offer potential for studying highly pathogenic viruses. However, the effects of these different formats on virus infection remain unexplored, leaving their relative value unclear. In this study, we generated primary lung organoids from human donor cells and used them to derive monolayers and air-liquid interface (ALI) cultures with the goal of comparing the replication kinetics of two circulating highly pathogenic coronaviruses, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). Infection studies revealed that organoid-derived monolayers displayed limited infection, and the innate immune response was impaired against bacterial lipopolysaccharide (LPS) but not against virus-like double-stranded RNA (dsRNA) or poly(I:C). Meanwhile, organoids and organoid-derived ALI cultures retained viral permissivity, with ALI cultures displaying diverse antiviral immune responses against both coronaviruses. SARS-CoV-2 and MERS-CoV demonstrated differential replication kinetics in organoid and organoid-derived ALI cultures. Therefore, primary organoid-derived cells in two-dimensional monolayer or three-dimensional ALI formats influence virus infection and host antiviral responses. Our study informs the selection of culture conditions for organoid-based respiratory disease research and therapeutic testing. IMPORTANCE: The COVID-19 pandemic heralded the upsurge in human-derived lung organoid-based studies due to their cellular heterogeneity that partly emulates the cellular complexity of the respiratory tract. A major disadvantage of organoid models resides in their apical-in conformation that "hides" cells and proteins that are typically exposed to the air-liquid interface (ALI) in the airways and are targets of viruses. Here, we generated monolayers and ALI cultures to facilitate cell exposure to highly relevant pathogens and compared them to parental organoids. Organoids at the ALI captured infection and immune responses better than organoids and organoid-derived monolayer cultures. Organoids at the ALI are a viable approach to improve identification and characterization of virus infection, host responses, and therapeutic testing.
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».