Safe and efficient transportation of clinical samples for molecular detection of African swine fever virus
Notice bibliographique
Résumé
African swine fever (ASF) continues to devastate swine populations across the globe. The causative agent, ASF virus (ASFV), is very stable and can remain infectious over long periods of time especially in contaminated blood and tissue samples. Therefore, the transport of clinical samples from the field to diagnostic laboratories requires special precautions to reduce the risk of spreading the disease. Inactivation of ASFV in the clinical samples prior to transporting to the lab eliminates the risk and the requirement of higher biosafety facilities to perform ASF diagnostics. This study evaluated the use of a commercial molecular transport medium (MTM) to inactivate ASFV and stabilize the viral DNA in cell culture and clinical samples collected from pigs inoculated with different ASFV strains. In all the sample types tested, complete inactivation of ASFV was observed, without affecting the subsequent detection of ASFV genomic material by real time polymerase chain reaction (real time PCR). The MTM preserved the stability of ASFV genomic material eliminating the need to refrigerate clinical samples. The data shows that the MTM can be used reliably to ensure safety and stability of routine clinical samples such as whole blood, spleen swabs and alternative sample types such as oral fluid, allowing expansion and streamlining ASF molecular diagnostics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».