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Enregistrement W4414397545 · doi:10.3389/fcimb.2025.1630865

Safe and efficient transportation of clinical samples for molecular detection of African swine fever virus

2025· article· en· W4414397545 sur OpenAlexafffund
J. G. Rempel, Chukwunonso Onyilagha, Kalhari Goonewardene, Aruna Ambagala

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Disease Management and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of CalgaryCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesNational Agriculture and Food Research OrganizationCanadian Food Inspection Agency
Mots-clésAfrican swine fever virusAfrican swine feverPolymerase chain reactionVirusReal-time polymerase chain reactiongenomic DNASpleen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

African swine fever (ASF) continues to devastate swine populations across the globe. The causative agent, ASF virus (ASFV), is very stable and can remain infectious over long periods of time especially in contaminated blood and tissue samples. Therefore, the transport of clinical samples from the field to diagnostic laboratories requires special precautions to reduce the risk of spreading the disease. Inactivation of ASFV in the clinical samples prior to transporting to the lab eliminates the risk and the requirement of higher biosafety facilities to perform ASF diagnostics. This study evaluated the use of a commercial molecular transport medium (MTM) to inactivate ASFV and stabilize the viral DNA in cell culture and clinical samples collected from pigs inoculated with different ASFV strains. In all the sample types tested, complete inactivation of ASFV was observed, without affecting the subsequent detection of ASFV genomic material by real time polymerase chain reaction (real time PCR). The MTM preserved the stability of ASFV genomic material eliminating the need to refrigerate clinical samples. The data shows that the MTM can be used reliably to ensure safety and stability of routine clinical samples such as whole blood, spleen swabs and alternative sample types such as oral fluid, allowing expansion and streamlining ASF molecular diagnostics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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