Genome-wide characterization of chemosensory receptor genes in octopus and identification of key genes involved in paralarval benthic settlement
Notice bibliographique
Résumé
The high mortality rate during the benthic settlement process of Octopus sinensis paralarvae represents the primary technical bottleneck constraining the development of its aquaculture industry. The functional roles of chemical factors in this critical transitional phase are unknown. Considering the crucial role of chemosensory receptor genes in chemical factor perception, this study identified three classes of chemosensory receptor genes—Olfactory Receptors (ORs), Ionotropic Receptors (IRs), and Acetylcholine Receptors (ARs)—in both merobenthic species ( O. sinensis , Octopus vulgaris ) and holobenthic species ( Octopus minor , Amphioctopus fangsiao ). The results demonstrated that the number of chemosensory receptor genes identified in all species in this study was comparable. Tissue expression analysis revealed that IRs were widely expressed across multiple olfaction-related organs, while the cephalopod-specific ARs were predominantly expressed in suckers and sucker epithelium. From hatching to adulthood, merobenthic paralarvae exhibited downregulation of nearly half of their chemosensory receptor genes, whereas holobenthic paralarvae showed only about 10 % gene downregulation, reflecting distinct chemosensory receptor expression patterns driven by divergent ecological adaptations between the hatchlings of these two life-history strategies. Based on the analysis of chemosensory receptor gene expression levels at different developmental stages of merobenthic paralarvae, RYamide receptor, Cholecystokinin receptor A (CCKAR), and Free fatty acid receptor 4 (FFAR4) were identified as potential key chemosensory receptor genes involved in the benthic settlement process. All three genes were functionally linked to feeding regulation, suggesting that chemical factors may regulate paralarval physiological functions related to feeding, thereby helping paralarvae conserve energy while awaiting the maturation of their nervous system and arm functionality, which would facilitate a successful transition to benthic settlement. This study laid a solid foundation for identifying key chemical factors involved in the benthic settlement process, which will contribute to breakthroughs in artificial seedling breeding techniques for O. sinensis and promote the development of its aquaculture industry. • The number of chemosensory receptor genes in merobenthic octopod and holobenthic octopod was conserved. • The cephalopod-specific acetylcholine receptors were predominantly expressed in suckers and sucker epithelium. • From hatching to adulthood, merobenthic and holobenthic octopod showed different chemosensory receptor expression patterns. • Three key chemosensory receptor genes identified in merobenthic octopod were all functionally linked to feeding regulation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».