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Enregistrement W4414690195 · doi:10.1101/2025.10.01.679595

Nuclear lamina-associated domain biogenesis is regulated by nuclear pore density during embryogenesis and mediates UV protection

2025· preprint· en· W4414690195 sur OpenAlexaff
Adrián Fragoso-Luna, Itai Sharon, Angelo L. Angonezi, Ohad Medalia, Peter Askjaer, Susan E. Mango

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeterochromatinEmbryoBiogenesisEmbryogenesisDNALaminNuclear laminaCell nucleus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Lamina-associated domains (LADs) are critical for genome organization and function, but their formation during development is not well understood. Here, we use DamID and image analysis to reveal the dynamics of LAD biogenesis during C. elegans embryogenesis. At early stages, DNA at the lamina is transcriptionally active and lacks lamina-associated heterochromatin. This state depends on abundant nuclear pores, which prevent heterochromatin accumulation at the nuclear periphery. As development proceeds, pore numbers decline, enabling heterochromatin to access the lamina. Reducing nuclear-pore components induces precocious accumulation of heterochromatin to the lamina. Functionally, we find that heterochromatic LADs confer protection against ultraviolet (UV) radiation. Older embryos are resistant to UV light and concentrate DNA damage at the nuclear periphery, whereas early embryos are UV sensitive and accumulate damage throughout nuclei when unshielded by their mothers in utero . These findings identify embryonic dissipation of nuclear pores as a key step in heterochromatic LAD assembly, allowing older embryos to withstand exposure to UV irradiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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