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Enregistrement W4414763249 · doi:10.1101/2025.10.01.25337054

The Brain Imaging and Neurophysiology Database: BINDing multimodal neural data into a large-scale repository

2025· preprint· en· W4414763249 sur OpenAlexaff
Charlotte Maschke, Peter Hadar, Yi‐Cheng Zhang, Li Jian, Gauri Ganjoo, Andrew Hoopes, Alessandro Guazzo, Aditya Gupta, Manohar Ghanta, Bruce D. Nearing, Christine Tsien Silvers, Bharath Gunapati, Jennifer A. Kim, Shibani S. Mukerji, Adrian V. Dalca, Sahar F. Zafar, Alice Lam, Emmanuel Mignot, M. Brandon Westover

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueNeural Networks and Applications
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroimagingNeurophysiologyElectroencephalographyNeuroinformaticsMedical imagingClinical neurophysiologyBrain mapping

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1 The Brain Imaging and Neurophysiology Database (BIND) represents one of the largest multi-institutional, multimodal, clinical neuroimaging repositories, comprising 1.8 million brain scans from 38,945 patients, linked to neurophysiological recordings. This comprehensive dataset addresses critical limitations in neuroimaging research by providing unprecedented scale and diversity across pathologies and health. BIND integrates de-identified data from Massachusetts General Hospital, Brigham and Women's Hospital, and Stanford University, including 1,723,699 MRI scans (1.5 Tesla, 3 Tesla, and 7 Tesla), 54,137 CT scans, 5,093 PET scans, and 526 SPECT scans, converted to standardized NIfTI format following BIDS organization. The database spans the full age spectrum (newborn to 106 years) and encompasses diverse neurological conditions alongside healthy patients. We deployed Bio-Medical Large Language Models to extract structured clinical metadata from 84,960 brain-related reports, categorizing findings into standardized pathology classifications. All imaging data are linked to previously published EEG and polysomnography recordings from the Harvard Electroencephalography Database, enabling unprecedented multimodal analyses. BIND is freely accessible for academic research through the Brain Data Science Platform ( https://bdsp.io/ ). This resource facilitates large-scale neuroimaging studies, machine learning applications, and multimodal brain research to accelerate discoveries in clinical neuroscience.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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