MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414787920 · doi:10.1371/journal.ppat.1013560

West Nile virus vaccine candidates attenuated by dinucleotide enrichment are immunogenic and protective against lethal infection

2025· article· en· W4414787920 sur OpenAlexaff
Nguyen Phuong Khanh Le, Prince Pal Singh, Ivan Trus, Uladzimir Karniychuk

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunogenicityCpG siteInterferonReversionVirusAmino acidRNAImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

West Nile virus (WNV) poses a global public health threat. This study demonstrates that the WNV RNA tolerates CpG and UpA dinucleotide enrichment in different genomic regions resulting in attenuation of CpG- and CpG/UpA-enriched variants. Attenuation was zinc finger antiviral protein 1 (ZAP)-dependent, and ZAP knockout (ZAP-KO) cells were used to generate high-titer stocks. Ten enriched variants, with permuted control and wild-type (WT) viruses, were screened in immunocompetent mice upon intraperitoneal injection. In contrast to lethal WNV-WT and permuted viruses, the E-MAX variant, with the RNA region encoding envelope (E) protein enriched both with CpG and UpA, caused no mortality. E-MAX was immunogenic and protective against lethal challenge. Stability of enriched dinucleotides was confirmed upon serial passaging in ZAP-WT and ZAP-KO cells, with only minor (17-21%) reversion at a single site in ZAP-WT condition. E-MAX upregulated interferon (IFN) signaling genes in human cells, suggesting that the combination of CpG/UpA-mediated attenuation, and concurrent activation of IFN responses potentially driven by CpG/UpA enrichment, may contribute to E-MAX immunogenicity. Evaluation using footpad injection in mice showed E-MAX had a promising safety and immunogenicity profile, although brain infection was occasionally detected. Then, we developed the E-MAX+ FR variant by combining CpG/UpA enrichment with two amino acid substitutions in functional domains of the E protein. This strategy eliminated neuroinvasion while maintaining immunogenicity and protection. Altogether, CpG/UpA dinucleotide enrichment in the genomic E region in combination with amino acid substitutions in the E protein yields a promising platform for vaccine development against WNV and potentially other flaviviruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,687
Score d'incertitude au seuil0,887

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS PathogensMême sujetMosquito-borne diseases and controlTravaux en français237 207