Phylogenomic placement and morphological description of a novel phagotrophic euglenid from Hawaii: <i>Hokulea waialensis</i> n. gen. et sp
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Euglenids are a diverse group of flagellated protists that include phagotrophic, osmotrophic, and phototrophic lineages. Understanding the phylogenetic relationships of phagotrophic euglenids is crucial in understanding euglenid evolution as a whole. Yet many relationships within euglenids remain unclear, and further resolution requires extensive sampling, particularly from the deep-branching, paraphyletic group known as ‘ploeotids’. Improved resolution of evolutionary relationships among ploeotid taxa is necessary to elucidate the origin and diversification of complex ultrastructural traits (e.g., pellicle, feeding apparatus). Here, we isolated, cultivated and characterized a novel ‘ploeotid’ species named Hokulea waialensis n. gen. et sp. using light and scanning electron microscopy, single-cell sequencing, and phylogenomic analyses. This new species is relatively small (10-12 µm long) compared to related euglenids, and shares several morphological traits with related species of Alistosa. Both single and multigene phylogenetic reconstructions from single amplified genome data show that Hokulea waialensis n. gen. et sp. is closely related to several environmental small subunit ribosomal DNA (SSU rDNA) sequences, and more broadly to Lentomona s and Decastava .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».