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Enregistrement W4414806354 · doi:10.1101/2025.10.03.680348

Cathepsin K as a Key Protease in Processing of SARS-CoV-2 Spike Activation Sites and a Target of Dual-Inhibition

2025· preprint· en· W4414806354 sur OpenAlexafffund
Seyed Yasin Tabatabaei Dakhili, Dipon Saha, Preety Panwar, Olivier Hinse, Yu Seby Chen, Bryan J. Fraser, C.H. Arrowsmith, Masahiro Niikura, Filip Van Petegem, Dieter Brömme

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCalifornia HIV/AIDS Research Program
Mots-clésEndosomeProteasesCathepsinCathepsin BCathepsin OCysteine proteaseProteaseCathepsin CCysteineCathepsin S

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SARS-CoV-2 relies on host proteases to prime its spike protein for cell entry through either the endosomal or plasma membrane pathway. Although cysteine cathepsins are known to mediate the endosomal route, the identity of the dominant enzyme has remained unclear. Here, we identify human Cathepsin K (hCatK), a lysosomal cysteine protease, as a previously unrecognized yet functionally important mediator of spike activation. While human Cathepsin L (hCatL) has long been regarded as the principal endosomal protease for spike processing, inhibition of hCatK with the selective inhibitor Odanacatib suppressed viral infection in endothelial cells as effectively as the broad-spectrum cysteine protease inhibitor E-64d, implicating hCatK as a key driver of spike processing during the endosomal viral entry. Comprehensive enzymatic profiling demonstrated that hCatK exhibits 24- to 63-fold higher catalytic efficiency toward the Furin-cleavage site (FCS) sequence than hCatL and displays a distinct substrate-recognition pattern at the Omicron FCS relative to the Wuhan variant. We further demonstrate that hCatK is an off-target of Nirmatrelvir, a clinically approved 3CL-Mpro inhibitor, with a sub-micromolar potency (IC 50 = 0.6 ± 0.1 µM). A 1.9 Å crystal structure of the hCatK–Nirmatrelvir complex delineates the molecular basis of inhibitor binding and supports the rational design of dual-acting antivirals. Collectively, these findings redefine the landscape of host proteases involved in SARS-CoV-2 spike activation and establish hCatK as a previously overlooked but strategic target for antiviral intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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