Methylation in ambient ion source enables direct isomer differentiation of oligosaccharides by tandem mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
Oligosaccharides are carbohydrate polymers with prebiotic, immunomodulatory, and antimicrobial activities. However, their structural complexity makes it challenging for characterization. In this work, we demonstrated a powerful instant in situ methylation approach to derivatize oligosaccharides with tetramethylammonium hydroxide (TMAH) in an ambient ion source known as direct analysis in real time (DART). The reaction occurs instantaneously when the sample and TMAH mixture is bombarded by excited-state helium from the DART source, and the methylated species are simultaneously charged through the Penning process. Mass spectrometry (MS) showed the formation of partial, full, and per-methylation products, along with methylated saccharide fragments. Unique fragmentation patterns can be generated because of the enhancement on the structural differences of isomers when fully or partially methylated. By using accurate mass and tandem MS (MS/MS), we demonstrated that trisaccharide and pentasaccharide isomers with subtle structural variations produced distinctively characteristic fragment ions. Isomeric saccharides in mixtures were qualitatively identified, and trisaccharide isomers in real samples were quantified. Varying degrees of polymerization of oligosaccharides, and their stereochemical and other isomeric differences were directly characterized. This method is significantly simpler compared to currently used workflow, and the time-consuming chromatographic separation step was eliminated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».