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Enregistrement W4414836696 · doi:10.15562/ism.v15i3.2221

Polimorfisme PTPN22 rs2476601 terhadap diabetes tipe 1 pada anak-anak di Benua Asia: Sebuah tinjauan sistematik dan meta analisis

2024· article· en· W4414836696 sur OpenAlexaboutno aff
I Made Wira Saputra, Romy Windiyanto

Notice bibliographique

RevueIntisari Sains Medis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet, Metabolism, and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTPN22Incidence (geometry)Meta-analysisType 1 diabetesAlleleDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The incidence of T1DM in childhood and adolescence continues to rise, with rates reaching 22.9 new cases per year per 100,000 children up to 15 years of age. A single nucleotide polymorphism (SNP) at position 1858 (rs2476601) in the coding sequence of the PTPN22 gene results in an Arg to Trp mutation, which increases the risk of T1DM in pediatric patients. This systematic review aims to determine the role of PTPN22 rs2476601 polymorphism on the incidence of type 1 diabetes in children on the Asian continent. Methods: This article is a systematic review and meta-analysis study using the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guideline, using keywords such as Polymorphism OR single nucleaotide AND PTPN22 AND rs2476601 OR C1858T AND Type 1 Diabetic AND Children OR Paediatric. Articles were obtained from several databases such as Google Scholar, Pubmed, Cochrane, Sciendirect. Articles obtained will be screened based on inclusion and exclusion criteria. Study quality will be assessed using the Newcastle Ottawa Scale (NOS). Data were analyzed using Review Manager 5.4 software. Heterogeneity was evaluated using Higgins I². Results: Seven relevant studies were included in this study. The analysis showed that the incidence of type 1 diabetes mellitus was significantly higher in patients with the T allele (SNP rs2476601) compared to the C allele (OR: 0.09; 95% CI: 0.07-0.10; p<0.001; heterogeneity χ²=150.75; I²=99%; p-heterogeneity<0.001; df=2). In addition, the incidence of type 1 diabetes mellitus was also significantly higher in patients who had the A allele compared to the G allele (OR: 0.04; 95% CI: 0.03-0.06; p<0.001; heterogeneity χ² = 93.20; I² = 98%; p-heterogeneity<0.001; df =2). Conclusion: SNP rs2476601 in the PTPN22 gene increases the risk of developing T1DM in children. Pendahuluan: Insiden DMT1 pada masa kanak-kanak dan remaja terus meningkat, dengan angka mencapai 22,9 kasus baru per tahun per 100.000 anak hingga usia 15 tahun. Polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) pada posisi 1858 (rs2476601) pada urutan pengkodean gen PTPN22 menghasilkan mutasi Arg menjadi Trp, yang meningkatkan risiko DMT1 pada pasien anak. Tinjauan sistematis ini bertujuan untuk mengetahui peran polimorfisme PTPN22 rs2476601 terhadap kasus diabetes tipe 1 pada anak-anak di benua Asia. Metode: Artikel ini merupakan studi systematic review dan meta-analisis yang menggunakan guideline Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA), menggunakan kata kunci berupa Polymorphism OR single nucleaotide AND PTPN22 AND rs2476601 OR C1858T AND Type 1 Diabetic AND Children OR Paediatric. Artikel diperoleh dari beberapa database seperti Google Scholar, Pubmed, Cochrane, Sciendirect. Artikel yang diperoleh akan diskrining berdasarkan kriteria inklusi dan eksklusi. Kualitas studi akan dinilai menggunakan Newcastle Ottawa Scale (NOS). Data dianalisis dengan menggunakan perangkat lunak Review Manager 5.4. Heterogenitas dievaluasi dengan menggunakan Higgins I². Hasil: Didapatkan tujuh penelitian relevan yang diinklusi pada studi ini. Hasil analisis menunjukkan bahwa kejadian diabetes melitus tipe 1 secara signifikan lebih banyak terjadi pada pasien yang memiliki alel T (SNP rs2476601) dibandingkan dengan alel C (OR: 0,09; 95% CI: 0,07-0,10; p<0,001; heterogenitas χ² = 150,75; I² = 99%; p-heterogenitas<0,001; df =2). Selain itu, kejadian diabetes melitus tipe 1 juga secara signifikan lebih banyak terjadi pada pasien yang memiliki alel A dibandingkan dengan alel G (OR: 0,04; 95% CI: 0,03-0,06; p<0,001; heterogenitas χ² = 93,20; I² = 98%; p-heterogenitas<0,001; df =2). Simpulan: SNP rs2476601 pada gen PTPN22 meningkatkan risiko terjadinya DMT1 pada pada anak.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,079

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,030
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

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Publié2024
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