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Enregistrement W4414957829 · doi:10.1073/pnas.2522352122

Guanine storage vacuoles sequester guanine crystals and serve as nitrogen reserves in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>

2025· article· en· W4414957829 sur OpenAlexafffund
Ursula Goodenough, Robyn Roth, Jae-Hyeok Lee

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSpectroscopy and Quantum Chemical Studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesRES’EAU-WaterNETNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOffice of Energy Efficiency and Renewable EnergyInternational Center for Energy, Environment and Sustainability, Washington University in St. LouisU.S. Department of Energy
Mots-clésGuanineVacuoleCytoplasmContext (archaeology)Raman spectroscopyAmorphous solid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nitrogen cycles in Chlamydomonas reinhardtii have historically been studied in the context of exogenous ammonium/nitrate availability and uptake. Recently, crystalline guanine has been identified, using Raman microscopy, in the cytoplasm of numerous microalgae, including C. reinhardtii . The signal level is influenced by availability of exogenous nitrogen, suggesting that the deposits serve as a nitrogen store. We report the visualization of these guanine crystals in C. reinhardtii and other microalgae using quick-freeze deep-etch electron microscopy. They prove to reside within cytoplasmic vacuoles: A membrane with a high density of small intramembranous particles surrounds a uniform, coarsely granular interior matrix within which stacks of flat crystals assemble, often in stunning abundance. We designate these as guanine storage vacuoles (GSVs). In C. reinhardtii and other members of the Chlamydomonadales, a discrete disc-shaped granular domain occupies the center of each GSV, and the crystals arise within or at the edges of this domain, suggesting that it represents an amorphous form of guanine. In C. reinhardtii , GSVs are numerous in log-phase cells, are not found in cells maintained in nitrogen-free medium, and reappear within 8 h after the cells are provided with nitrogen, initially as small disc-containing vacuoles. We compare this cycle with that of the polyphosphate granules localized in acidocalcisomes. Nineteen enzyme families and 10 transporters are predicted to participate in guanine-related pathways in C. reinhardtii , many showing strong upregulation with nitrogen starvation. These understandings will inform future studies on the contributions made by GSVs to the metabolism and physiology of eukaryotic microalga.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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