Identification of plasmid-mediated tigecycline resistance <i>tet</i> (x4) and New Delhi metallo-β-lactamase (NDM) in an <i>Escherichia coli</i> isolate from Canada
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Rapid spread of carbapenemase-producing Enterobacterales is a global health threat for which tigecycline is one of the few remaining therapeutic options. Resistance by tet (x4) is particularly worrisome, given its presence on mobile genetic elements. Here we report on a tigecycline-resistant Escherichia coli strain isolated from a patient returning from Pakistan. A tet (x4) gene was found on an IncFII plasmid isolated from an ST410 E. coli co-harboring NDM-5. The combination of carbapenemase and tet (x4) is concerning. IMPORTANCE Tigecycline is one of the few last-resort therapeutic options available for treating multidrug-resistant gram-negative bacterial infections, particularly of interest in carbapenemase-producing isolates. Mobile tigecycline resistance is still relatively rare, especially in North America and among clinical isolates. Here we describe the identification of a high-risk clone ( E. coli ST410) in Canada that contains the tigecycline resistance gene tet (x4) on an IncFII plasmid and bla NDM-5 on a separate IncFIB plasmid. Here, we highlight a rare resistance gene in combination with a carbapenemase, both of which are plasmid mediated, complicating antimicrobial treatment options.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».