High prevalence of MDR and XDR Escherichia coli in hospital wastewater from Shiraz, Iran: ESBL and carbapenemase production
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Hospital wastewater (HWW) is a significant reservoir for multidrug-resistant (MDR) bacteria and antimicrobial resistance (AMR) genes, posing serious public health risks. This study investigated the phenotypic and genotypic resistance profiles of Escherichia coli (E. coli) isolates from HWW in Shiraz, Iran. Thirty-six HWW samples (18 influent, 18 effluent) were collected weekly over six weeks from three major hospitals. E. coli isolates were identified and assessed for antimicrobial susceptibility, extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and carbapenemase production, resistance genes, phylogroups, and sequence types (STs). RESULTS: A total of 68 E. coli isolates were obtained (33 influent, 35 effluent). High resistance rates were observed for ampicillin (97.1%), cefazolin, and amoxicillin/clavulanic acid (86.8%). The lowest resistance rates were to imipenem (5.9%), meropenem (13.2%), and chloramphenicol (19.1%). MDR and extensively drug-resistant (XDR) profiles were identified in 80.9% and 22.1% of isolates, respectively. ESBL production was found in 57.4% of isolates. All nine carbapenem-resistant isolates were tested by both modified carbapenem inactivation method (mCIM) and EDTA-CIM (eCIM); eight (88.9%) were positive by mCIM, while all were negative by eCIM. Resistance genes detected included blaTEM (39.7%), blaCTX-M (33.8%), and blaSHV (2.9%). Three isolates carried blaOXA-48, while one carried blaIMP and another carried blaVIM. Phylogroup B2 was most frequent (22.1%), with ST131 being the dominant type (33.8%). CONCLUSION: In conclusion, HWW may serve as a potential reservoir for resistant and pathogenic E. coli isolates, indicating the importance of monitoring wastewater as a step in addressing the issue of AMR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».