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Enregistrement W4414994583 · doi:10.1186/s12866-025-04398-2

High prevalence of MDR and XDR Escherichia coli in hospital wastewater from Shiraz, Iran: ESBL and carbapenemase production

2025· article· en· W4414994583 sur OpenAlexaff
Abolfazl Rafati Zomorodi, Mohammad Reza Samaei, Himen Salimizand, Mohammad Hassan Parvizi Mashhadi, Mohammad Motamedifar

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensSaskatoon Medical ImagingUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesShiraz UniversityShiraz University of Medical Sciences
Mots-clésMeropenemEscherichia coliImipenemAntibiotic resistanceAmpicillinAntimicrobialCarbapenemGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hospital wastewater (HWW) is a significant reservoir for multidrug-resistant (MDR) bacteria and antimicrobial resistance (AMR) genes, posing serious public health risks. This study investigated the phenotypic and genotypic resistance profiles of Escherichia coli (E. coli) isolates from HWW in Shiraz, Iran. Thirty-six HWW samples (18 influent, 18 effluent) were collected weekly over six weeks from three major hospitals. E. coli isolates were identified and assessed for antimicrobial susceptibility, extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and carbapenemase production, resistance genes, phylogroups, and sequence types (STs). RESULTS: A total of 68 E. coli isolates were obtained (33 influent, 35 effluent). High resistance rates were observed for ampicillin (97.1%), cefazolin, and amoxicillin/clavulanic acid (86.8%). The lowest resistance rates were to imipenem (5.9%), meropenem (13.2%), and chloramphenicol (19.1%). MDR and extensively drug-resistant (XDR) profiles were identified in 80.9% and 22.1% of isolates, respectively. ESBL production was found in 57.4% of isolates. All nine carbapenem-resistant isolates were tested by both modified carbapenem inactivation method (mCIM) and EDTA-CIM (eCIM); eight (88.9%) were positive by mCIM, while all were negative by eCIM. Resistance genes detected included blaTEM (39.7%), blaCTX-M (33.8%), and blaSHV (2.9%). Three isolates carried blaOXA-48, while one carried blaIMP and another carried blaVIM. Phylogroup B2 was most frequent (22.1%), with ST131 being the dominant type (33.8%). CONCLUSION: In conclusion, HWW may serve as a potential reservoir for resistant and pathogenic E. coli isolates, indicating the importance of monitoring wastewater as a step in addressing the issue of AMR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,155
Score d'incertitude au seuil0,530

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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