NMR Analysis and Assignment of a Biosynthesis Gene Cluster for Trichokonins VI and VIII, Antiplasmodial Large Peptaibols Produced by a <i>Trichoderma</i> sp. Fungus
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Peptaibols are modified linear peptides that typically include an acyl fragment connected at the N -terminal moiety, a reduced acid extremity and α-aminoisobutyric acid residues as common features, as well as other structural modifications. Peptaibols very often display potent biological activity, in particular, antimicrobial activity. Trichokonins VI ( 1 ) and VIII ( 2 ) are large peptaibols composed of 20 amino acids, which were previously only characterized by analysis of MS/MS data. We herein report the first full characterization of trichokonins VI ( 1 ) and VIII ( 2 ) by analysis of NMR data, along with an analysis by electronic circular dichroism and HRMS/MS data. Also, full genome sequencing and analysis of Trichoderma sp. L2-2 allowed us to identify a peptaibol biosynthesis gene cluster and the proposal for a biosynthetic assembly of trichokonins VI and VIII. Trichokonins VI and VIII also demonstrated antiplasmodial activity at the submicromolar range against Plasmodium falciparum .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».