Sulfatase modifying factors control the timing of zebrafish convergence and extension morphogenesis
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT To shape the emerging body plan, morphogenetic cell movements must be coordinated not only in space, but also in time. Convergence and Extension (C&E) movements that elongate the anteroposterior axis initiate with precise timing during vertebrate gastrulation, but the mechanisms controlling their onset remain unknown. We examined this question using zebrafish embryonic explants that faithfully recapitulate C&E cell movements and their precise timing in culture, in isolation from other gastrulation movements. We determined that new transcription is required at gastrulation onset for C&E in explants and identified sulfatase modifying factor 2 ( sumf2 ) as a candidate ‘trigger’ gene expressed at this time. sumf2 and its paralog sumf1 encode negative and positive regulators, respectively, of all sulfatase enzymes, which remove sulfate groups from their substrates, altering their biological activity. In zebrafish embryos and explants, sumf1 and sumf2 expression levels invert at gastrulation onset, predicting a reduction in sulfatase activity and consequent increase of substrate sulfation. We found that overexpressing sumf1 and sumf2 causes delayed or precocious C&E onset, respectively, whereas loss of sumf1 and sumf2 function shifts C&E timing in the opposite direction. We further identified Sulf1, an extracellular sulfatase that modifies heparan sulfate proteoglycans (HSPGs), as the key effector by which sumf1 and sumf2 control C&E timing. Accordingly, reduced or increased levels of sulfated heparan sulfate similarly shift C&E onset and suppress sumf1 and sumf2 mutant phenotypes. Together, our work supports a model in which sumf2 expression at zebrafish gastrulation onset reduces sulfatase activity, rewriting HSPG sulfation patterns to promote and/or permit C&E morphogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».