Identification of novel collagen breakdown products by human osteoclasts in vitro and in vivo
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Bone resorption involves dissolution of minerals and enzymatic degradation of bone matrix. The primary enzyme is cathepsin K but other proteases including matrix metalloproteinases are involved. Some cathepsin K cleavage products have been partially identified, including cross-linked telopeptides of type I collagen. Here, we aimed to characterize the entire complement of bone breakdown products resulting from osteoclast action under controlled conditions in vitro. We analyzed extracellular media from human osteoclasts cultured on dentin substrates, using untargeted liquid chromatography mass spectrometry. We discovered 22 breakdown products resulting from osteoclastic action. These products were peptide fragment sequences that mapped to various collagen proteins present in bone and dentin. Nine peptide fragments mapped exclusively to collagen I alpha-1 chain (COL1A1), the most abundant protein in bone. We subsequently detected 21 of the fragment products, initially observed in vitro, in human serum and/or urine. Consistent positive correlations were observed between the COL1A1-specific peptide fragments and established bone biochemical markers in serum and urine. Ten urine fragments and two serum fragments markedly increased (p < .05) following total hip arthroplasty, capturing the transient local peri-prosthetic osteolysis observed in these patients (serum, n = 86 patients; urine, n = 83 patients). Among these candidate osteolytic markers, four (two COL1A1-specific products) showed decreases from baseline (p < .05) in patients on denosumab (n = 10 patients). Additionally, two fragment peptides were higher (p < .05, fold change >2) in urine from patients with bone metastasis (24 out of 112) among a lung cancer cohort. The range of collagen peptide fragments we discovered as a direct result of osteoclast activity indicates a complexity of bone resorption pathways not previously known, extending beyond the known proteolytic cleavage events in bone collagen proteins. Monitoring biofluid concentrations of these novel bone markers has the potential to capture multiple pathways of bone resorption activity beyond the existing assays based on cathepsin K.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».