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Enregistrement W4415077664 · doi:10.1093/jbmrpl/ziaf160

Identification of novel collagen breakdown products by human osteoclasts in vitro and in vivo

2025· article· en· W4415077664 sur OpenAlexaff
Brendan P. Norman, J.P. Dillon, S Alkharabsheh, Francoise Congues, Peter J. Wilson, Andrew Davison, Elinor Chapman, J. Baker, Séamus Coyle, C Probert, Paul E. Beaulé, L. Ranganath, J. Mark Wilkinson, James A. Gallagher

Notice bibliographique

RevueJBMR Plus · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueCollagen: Extraction and Characterization
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBone resorptionPeptideCathepsinOsteoclastCathepsin KIn vivoMatrix metalloproteinaseProteasesResorption

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bone resorption involves dissolution of minerals and enzymatic degradation of bone matrix. The primary enzyme is cathepsin K but other proteases including matrix metalloproteinases are involved. Some cathepsin K cleavage products have been partially identified, including cross-linked telopeptides of type I collagen. Here, we aimed to characterize the entire complement of bone breakdown products resulting from osteoclast action under controlled conditions in vitro. We analyzed extracellular media from human osteoclasts cultured on dentin substrates, using untargeted liquid chromatography mass spectrometry. We discovered 22 breakdown products resulting from osteoclastic action. These products were peptide fragment sequences that mapped to various collagen proteins present in bone and dentin. Nine peptide fragments mapped exclusively to collagen I alpha-1 chain (COL1A1), the most abundant protein in bone. We subsequently detected 21 of the fragment products, initially observed in vitro, in human serum and/or urine. Consistent positive correlations were observed between the COL1A1-specific peptide fragments and established bone biochemical markers in serum and urine. Ten urine fragments and two serum fragments markedly increased (p < .05) following total hip arthroplasty, capturing the transient local peri-prosthetic osteolysis observed in these patients (serum, n = 86 patients; urine, n = 83 patients). Among these candidate osteolytic markers, four (two COL1A1-specific products) showed decreases from baseline (p < .05) in patients on denosumab (n = 10 patients). Additionally, two fragment peptides were higher (p < .05, fold change >2) in urine from patients with bone metastasis (24 out of 112) among a lung cancer cohort. The range of collagen peptide fragments we discovered as a direct result of osteoclast activity indicates a complexity of bone resorption pathways not previously known, extending beyond the known proteolytic cleavage events in bone collagen proteins. Monitoring biofluid concentrations of these novel bone markers has the potential to capture multiple pathways of bone resorption activity beyond the existing assays based on cathepsin K.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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