Study of the transcription factor ATF5 in a background of HIV/SIV infection
Notice bibliographique
Résumé
Le VIH est un rétrovirus enveloppé à ARN simple brin infectant notamment les lymphocytes T et les monocytes, et entrainant le Syndrome d'Immunodéficience Acquise (SIDA). L'infection par le VIH altère les fonctions des cellules, engendrant un stress. L'activation de la kinase PKR par l'ARN du VIH permet d'initier une des réponses au stress cellulaire, l'Integrated Stress Response (ISR). Les facteurs de transcription ATF4 et ATF5 sont deux paralogues dont la traduction peut être stimulée par l'ISR et ils pourraient être impliqués dans le contrôle du cycle viral. De manière intéressante, la littérature a démontré qu'ATF4 coopère avec la protéine virale Tat et se fixe sur le promoteur viral, favorisant ainsi la réplication du VIH. ATF5, pour sa part, semble induit dans plusieurs infections virales mais son rôle dans l'infection et la réplication du VIH est encore méconnu. Au cours de cette thèse, j'ai cherché à déterminer si ATF5 combattait l'infection par le VIH, ou favorisait sa réplication. Nos travaux montrent que les niveaux de transcrits d'ATF4 et ATF5 sont augmentés dans des lymphocytes T CD4 ainsi que dans des monocytes primaires humains infectés, mais pas dans le foie et les poumons de macaques rhésus infectés par le VIS, l'homologue simien du VIH. Contrairement à celui d'ATF5, le taux de transcrits d'ATF4 est également augmenté dans la rate de ces singes. De plus, le niveau d'ARNm de PKR est accru dans ces trois organes de singes infectés par rapport à des singes contrôles. Enfin, les expériences menées dans une lignée cellulaire humaine suggèrent d'une part, qu'une inhibition d'ATF5 entrainerait une diminution de la production virale, et d'autre part, que Tat et ATF5 coopèrent pour activer le promoteur du VIH. L'ISR, PKR et ATF5 pourraient donc participer au cycle du VIH en agissant a minima à un niveau transcriptionnel. Ces travaux soulignent l'importance d'ATF5 dans l'infection et la réplication du VIH et pourraient orienter les recherches de stratégies thérapeutiques vers le contrôle des voies de réponses au stress.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».