Development and characterisation of a novel cell line derived from coho salmon (Oncorhynchus kisutch)
Notice bibliographique
Résumé
Coho salmon (Oncorhynchus kisutch) is an important salmonid species differing from other salmonids in its tolerance and response to pathogens endemic to the aquaculture industry, such as infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) and infectious salmon anaemia virus (ISAV). Consequently, coho salmon has become a subject of increased scientific interest to investigate the underlying genetic mechanisms behind these and other host-pathogen interactions. Currently, most research studying coho salmon has been conducted using live animal models as there have been few in vitro tools readily available. Here, we present the first cell line from an adult coho salmon, Coho Salmon Fibroblast-Like 1 Norway-Canada (CSFL-1NC) and its preliminary characterisation. CSFL-1NC is a homogenous, spontaneously immortalised cell line from the pectoral fin of a wild adult coho salmon, with a consistent and stable fibroblastic morphology. The cell line has a relatively stable transcriptome across several passages, with high expression of key fibroblastic marker genes, displays rapid migration, and can be genetically manipulated both by transfection and transduction with varying efficiency using plasmids, lentivirus, and/or CRISPR methodology. Virus challenges show clear susceptibility to IPNV as evidenced by cytopathic effects and efficient viral replication, yet it shows little to no response when exposed to ISAV (HPRD).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».