Leader-Independent C-Terminal Modification by a Radical <i>S</i> -Adenosyl- <scp>l</scp> -methionine Maturase Enables Macrocyclic GLP-1-Like Peptides
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs) are a rapidly expanding family of natural products in which biosynthetic maturase enzymes tailor ribosomal precursors into bioactive products. Classical RiPP maturation relies on an N-terminal leader sequence in the precursor peptide and a complementary RiPP-recognition element in the enzyme to guide substrate binding. Herein, we interrogated PapB, a radical S -adenosyl- l -methionine RiPP maturase known to introduce thio(seleno)-ether cross-links and discovered that its catalytic reach extends well beyond this paradigm. PapB efficiently processes substrates that lack any canonical leader sequence, demonstrating bona fide leader-independent activity. To highlight the practical value of this capability, we applied PapB to three therapeutically relevant analogues of glucagon-like peptide pathway agonists to generate C-terminal cyclic structures. In every case, the enzyme achieved complete conversion of the linear to the thioether macrocyclized peptide. These results establish PapB as a versatile, plug-and-play biocatalyst for late-stage macrocyclization of structurally diverse peptides, opening a direct route to conformationally constrained therapeutic candidates without the need for leader tags.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».