Comparative analysis of hsp16 and hsp70 heat shock protein families in <i>Caenorhabditis</i> nematodes
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The heat shock response (HSR), driven by molecular chaperons, is a key defense mechanism against proteotoxic stress. In nematodes, the hsp16 family and hsp70 family play central roles in the HSR, but their evolutionary conservation and expression patterns remain poorly understood. Here, we performed phylogenetic, genomic, and transcriptomic analyses of hsp16 and hsp70 genes in Caenorhabditis elegans and C. briggsae , and other related nematodes. Our findings show that hsp16 genes are rapidly evolving and often organized in clusters of closely spaced and oppositely oriented pairs. These genes show dynamic temporal expression in C. elegans and C. briggsae under basal, unstressed conditions. In contrast, hsp70 genes are more conserved across species and display stable expression. We also found that C. briggsae contains more orthologous HSP genes than C. elegans , and exhibits a higher proportion of constitutive expression, consistent with its greater thermal tolerance. These findings highlight the evolutionary diversification and functional organization of heat shock proteins in nematodes, offering insights into how genomic architecture and gene expression contribute to species-specific thermal adaptation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».