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Enregistrement W4415221388 · doi:10.1261/rna.080384.125

CSDE1 regulates the miR-20a-5p/TMBIM6 axis in melanoma

2025· article· en· W4415221388 sur OpenAlexaff
Sushmitha Ramakrishna, Yiming Jiang, Tanit Guitart, Fátima Gebauer, Pavan Kumar Kakumani

Notice bibliographique

RevueRNA · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMelanomaGene silencingmicroRNATranslation (biology)Function (biology)Regulation of gene expressionGene expressionMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA-binding proteins (RBPs) and microRNAs (miRNAs) play crucial roles in regulating gene expression at the post-transcriptional level in tumorigenesis. They primarily target the 3'UTRs of mRNAs to control their translation and stability. However, their coregulatory effects on specific mRNAs in the pathogenesis of particular cancers are yet to be fully explored. CSDE1 is an RBP that promotes melanoma metastasis, and the mechanisms underlying its function in melanoma development are yet to be fully understood. Here, we report that CSDE1 enhances TMBIM6 protein expression without altering its mRNA levels in melanoma cells, indicating post-transcriptional regulation. CSDE1 and AGO2 competitively bind to TMBIM6 mRNA, and we identify that miR-20-5p, which represses TMBIM6 expression, regulates the binding of CSDE1 to TMBIM6 mRNA. Further, the RNA-binding mutant of CSDE1 showed reduced affinity toward TMBIM6 mRNA, thus allowing AGO2-mediated silencing of TMBIM6 expression. Our study highlights the pivotal role of CSDE1 in regulating miR-20a-5p function and the expression of TMBIM6 in melanoma cells, thus unveiling the potential of therapeutic strategies targeting this regulatory pathway in treating malignant skin cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil0,211

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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