Enhanced replication of a contemporary avian influenza A H9N2 virus in human respiratory organoids
Notice bibliographique
Résumé
H9N2 is currently the second most common avian influenza A virus subtype infecting humans. Monitoring viral phenotypic and genotypic adaptation to humans is crucial for risk assessment. Here, we compared the replication of an H9N2 human isolate collected in 2024 (A/HK/2346/2024) to a historical human isolate collected in 1999 (A/HK/1073/1999). In Madin Darby canine kidney (MDCK) cells, A/HK/2346/2024 and A/HK/1073/1999 replicated to 8 log10 and 5 log10 plaque-forming units (PFU) per ml, respectively. In both human nasal and lung organoids, A/HK/2346/2024 replicated to 6 log10 PFU/ml, but A/HK/1073/1999 failed to replicate in either organoid. The infection rates of both ciliated and non-ciliated cells were higher for A/HK/2346/2024 than A/HK/1073/1999, and the ratios of infected 2,6/2,3 cells were also higher for A/HK/2346/2024. Apart from the mammalian adaptive substitutions that were present in the nasopharyngeal specimen collected on day 1 post-symptom onset (pso) (HA-D183N/D190 T/Q192R/Q226L; NA-del62-64; PB2-A588 V/K702R; PB1-I368 V; PA-K356R/S409N; M1-R95 K), the mammalian adaptive substitution PB2-D253N emerged de novo on day 7 pso. Analysis of all human (n = 96) and avian influenza (n = 14762) H9N2 deposited at GISAID showed the dominance of several human-adaptation substitutions in H9N2 strains collected from humans in recent years. In summary, we demonstrated that a recent H9N2 virus is more adapted to humans, and is able to replicate to high titers in both upper and lower human respiratory tract which may confer higher person-to-person transmissibility and virulence. Our study underscores the importance of human organoid-based phenotypic monitoring and inter/intrahost genotypic monitoring for assessing the zoonotic risk of avian influenza viruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».