Characterisation of ESBL-producing E. coli isolated from healthy broilers in Tunisia
Notice bibliographique
Résumé
The aim of this study was to investigate the frequency of antimicrobial resistance and the rate of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) in Escherichia coli isolated from caecum content collected in slaughterhouses located in three regions of Tunisia. E. coli isolates from chicken caecal samples, obtained using media supplemented with cefotaxime, were screened for antimicrobial susceptibility by the disk diffusion method. ESBL production was assessed by the double-disk synergy test, and the presence of β‑lactamase encoding resistance genes was evaluated by PCR. Out of 111 faecal samples, 108 samples were positive for E. coli isolated from media supplemented with cefotaxime with 70% of ESBL-producing isolates. Alarming proportions of resistance against most of the 21 tested antibiotics were observed with 90% of multidrug resistant strains. Most strains exhibited resistance to amoxicillin, cefepime, tetracycline, cephalothin, piperacillin, cefotaxime, aztreonam, streptomycin, ceftazidime, cefuroxime, chloramphenicol, and florfenicol. The same resistance patterns were found in comparison between the three chicken slaughterhouses. A high prevalence of β‑lactamase genes was observed, with bla CTX-M-G1 -ESBL in 79.6% of strains, bla TEM in 45.4%, and bla SHV in 33.3%. The bla CTX-M-G1 and bla TEM genes were significantly more frequent in strains from slaughterhouses A and C. Additionally, carbapenem resistance genes, bla OXA-48 and bla IMP , were demonstrated in 13% and 6.5% of strains, respectively. The study showed high frequency of ESBL-producing E. coli and high antibiotic resistance in broilers. Poultry farms could represent a significant reservoir of ESBL-producing bacteria, suggesting the dissemination of these pathogens to humans and environment. These findings indicate the need for achievement of control and surveillance system.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».