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Enregistrement W4415378460 · doi:10.1021/acs.jcim.5c01784

Unraveling the Disruptive Mechanism of Local Anesthetics on Raft-Like Ordered Membranes: Simulation Studies

2025· article· en· W4415378460 sur OpenAlexfundno aff
Sirin Sittiwanichai, Kodai Kanemaru, Masanao Kinoshita, Nobuaki Matsumori, Norio Yoshida

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Information and Modeling · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Science and Technology AgencyJapan Society for the Promotion of ScienceNational Research Council CanadaToyota Physical and Chemical Research InstituteMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésSteric effectsUmbrella samplingMembranePotential of mean forceTetracaineAmphiphileMolecular dynamicsVesicle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The membrane perturbation of local anesthetics (LAs) with distinct steric differences─dibucaine (Dib), tetracaine (Tet), and lidocaine (Lid)─as well as their behavior in different regions of the raft-like ordered (Lo) membrane, were investigated using umbrella sampling molecular dynamics (MD) simulations. Both uncharged (-u) and protonated (-p) forms were considered. Our findings from potential mean force (PMF), z -axis diffusion, and area per lipid (APL) confirmed that Dib-u preferentially located at the hydrophobic core, whereas Lid-u shows no specific localization preference and exhibits rapid diffusion across the Lo membrane. The steric effect drives the distinct translocation behavior of LAs-u but has no significant impact on LAs-p. These two factors─bulky properties and high affinity for the hydrophobic core, as observed in Dib-u─contribute to the membrane disruption. This observation is evidenced by the significantly lower PMF profile at the deep hydrophobic core, the greatest lipid packing disorder, and high steric bulk, which is in reasonable agreement with experimental observations. Three-dimensional reference interaction-site model (3D-RISM) analysis further supports the amphiphilic nature of LAs-u and an increase in hydrophilicity of LAs-p. This difference is a key factor modulating the action of LAs-u and LAs-p forms in different membrane environments. Our findings on the distinct behavior governing the Lo membrane translocation of LAs-u are influenced by preferred localization within the Lo membrane and the steric effect. These insights offer valuable insights for the anesthetic design and membrane-based biosensor development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,225

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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