Temperature modulates the protein dynamics of the antigen presentation pathway in VHSV IVb-infected rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) cell lines
Notice bibliographique
Résumé
Rainbow trout face challenges due to climate change, increasing their susceptibility to pathogens like viruses. The endogenous antigen presentation pathway is essential for antiviral immunity by presenting intracellular antigens to cytotoxic lymphocytes. While previous studies show impaired expression of antigen presentation molecules at suboptimal temperatures, little is known about how temperature affects the protein function of the antigen presentation pathway during viral infections. This study aims to understand how temperature modulates the antigen presentation pathway in rainbow trout infected with the viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) IVb. Rainbow trout cell lines were exposed to 4°C, 14°C, and 20°C and sampled at 1-, 4-, and 9-days post-infection (dpi). The cell surface expression of MHC-I and beta 2-microglobulin (β2m), the proteasome activity, β2m release and the secretion of IFN-I, were analyzed. Over the course of nine days, VHSV IVb-infected cells exposed to 14°C and 20°C, exhibited impaired MHC-I/β2m surface expression. In addition, proteasome activity was higher at 9 dpi at 14°C and 20°C, suggesting an increase in viral peptide processing. Release of β2m into the media, correlated with MHC-I recycling and trafficking, was detected at 14°C. Also, differences in secretion of IFN I were observed between control and infected cells at 14°C and 20°C. However, no differences were observed at 4°C, suggesting a reduced metabolic activity, impairing the virus’ ability to downregulate the antigen presentation pathway. These results highlight temperature-dependent modulation of antigen presentation and viral processing, emphasizing the critical role of temperature in immune responses agaisnt viruses. • MHC-I/β2m surface expression is reduced at lower temperatures during VHSV IVb infection. • The release of β2m indicates interference in MHC-I trafficking under suboptimal temperatures during VHSV IVb infection. • Proteasome activity is not impaired at suboptimal temperatures after infection with VHSV IVb • IFN-I secretion is suppressed at cold temperatures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».