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Enregistrement W4415390272 · doi:10.1016/j.fsi.2025.110956

Temperature modulates the protein dynamics of the antigen presentation pathway in VHSV IVb-infected rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) cell lines

2025· article· en· W4415390272 sur OpenAlexafffund
Valentina Wong‐Benito, Rochelle Supinski, Tania Rodríguez‐Ramos, Brian Dixon

Notice bibliographique

RevueFish & Shellfish Immunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésAntigen presentationRainbow troutAntigenCytotoxic T cellSecretionAntigen processingMHC class IProteasomeImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rainbow trout face challenges due to climate change, increasing their susceptibility to pathogens like viruses. The endogenous antigen presentation pathway is essential for antiviral immunity by presenting intracellular antigens to cytotoxic lymphocytes. While previous studies show impaired expression of antigen presentation molecules at suboptimal temperatures, little is known about how temperature affects the protein function of the antigen presentation pathway during viral infections. This study aims to understand how temperature modulates the antigen presentation pathway in rainbow trout infected with the viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) IVb. Rainbow trout cell lines were exposed to 4°C, 14°C, and 20°C and sampled at 1-, 4-, and 9-days post-infection (dpi). The cell surface expression of MHC-I and beta 2-microglobulin (β2m), the proteasome activity, β2m release and the secretion of IFN-I, were analyzed. Over the course of nine days, VHSV IVb-infected cells exposed to 14°C and 20°C, exhibited impaired MHC-I/β2m surface expression. In addition, proteasome activity was higher at 9 dpi at 14°C and 20°C, suggesting an increase in viral peptide processing. Release of β2m into the media, correlated with MHC-I recycling and trafficking, was detected at 14°C. Also, differences in secretion of IFN I were observed between control and infected cells at 14°C and 20°C. However, no differences were observed at 4°C, suggesting a reduced metabolic activity, impairing the virus’ ability to downregulate the antigen presentation pathway. These results highlight temperature-dependent modulation of antigen presentation and viral processing, emphasizing the critical role of temperature in immune responses agaisnt viruses. • MHC-I/β2m surface expression is reduced at lower temperatures during VHSV IVb infection. • The release of β2m indicates interference in MHC-I trafficking under suboptimal temperatures during VHSV IVb infection. • Proteasome activity is not impaired at suboptimal temperatures after infection with VHSV IVb • IFN-I secretion is suppressed at cold temperatures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,174
Score d'incertitude au seuil0,954

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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