Abstract C108: The therapeutic candidate antibody PODO447 recognizes a glycopeptide on podocalyxin-expressing tumor cells that have undergone a partial epithelial-mesenchymal transition
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In tumor cells, protein glycosylation patterns are often dramatically altered compared to normal cells. This leads to the emergence of novel neo-antigens on the tumour cell surface. Podocalyxin is a heavily glycosylated transmembrane sialomucin that is overexpressed in many solid tumors, with higher expression being significantly correlated with poor prognosis. We have developed a candidate therapeutic monoclonal antibody called PODO447 that binds to a tumor-associated altered glycoform of podocalyxin (Canals Hernaez et al., J Immunother Cancer. 2020 Nov;8(2):e001128). Clinically, the glycopeptide epitope recognized by PODO447 is present on a significant subset of podocalyxin-positive tumors and high expression of the epitope is associated with an aggressive ‘cold’ immune phenotype in patient tumors (Brassard et al., Front Oncol. 2023 Dec 21:13:1286754.). An antibody drug conjugate (ADC) that contains PODO447 as its targeting arm has shown promising results for tumor-killing efficacy in pre-clinical models of pancreatic and ovarian carcinoma (Canals Hernaez et al., Front Oncol. 2022 May 4:12:856424). As the expression of the PODO447 glycoepitope associates with aggressive tumor types, we assessed the phenotype of PODO447-expressing cells to better elucidate the potential role of the emergence of this novel epitope in tumor progression. The CFPAC-1 pancreatic ductal adenocarcinoma-derived cell line, while being universally podocalyxin-positive, contains subpopulations of cells that express either high or low levels of the PODO447 epitope. We were able to sort these two populations through fluorescent-activated cell sorting (FACS) and performed bulk RNA-seq, comparing expression patterns between these two populations. Interestingly, we found genes that are known markers of epithelial to mesenchymal transition (EMT) to be upregulated in PODO447High cells, including transcription factors (TWIST1, ZEB1, ZEB2) and extracellular matrix components and remodelling factors (FN1, ITGA5, COL1A1, MMP2, MMP13). CFPAC-1 PODO447High cells also have elevated N-cadherin levels compared to PODO447Low cells. In addition, while E-cadherin mRNA and total protein levels are unchanged, we found that the localization of E-cadherin is altered in PODO447High cells, being restricted to the intracellular compartment, compared to a junctional, cell surface localization in PODO447Low cells. Furthermore, the PODO447High cells have a more mesenchymal morphology and increased single-cell motility. Collectively, these data suggest that the emergence of the PODO447 epitope is associated with the acquisition of a partial EMT (p-EMT) phenotype that may functionally contribute to tumor progression. Targeting this tumor-specific podocalyxin epitope clinically with our antibody may prove effective in preventing disease progression. Citation Format: Pamela Austin Dean, Erin M. Bell, Stephane Flibotte, Anjali Parthasarathy, Lydia Liu, Aileen Liman, Julyanne Brassard, Kelly M. McNagny, Calvin D. Roskelley. The therapeutic candidate antibody PODO447 recognizes a glycopeptide on podocalyxin-expressing tumor cells that have undergone a partial epithelial-mesenchymal transition [abstract]. In: Proceedings of the AACR-NCI-EORTC International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics; 2025 Oct 22-26; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2025;24(10 Suppl):Abstract nr C108.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».