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Enregistrement W4415448134 · doi:10.1016/j.jbc.2025.110854

J-domain proteins cooperate with Hsp70 to drive multiphase separation of RNA-binding-deficient TDP-43

2025· article· en· W4415448134 sur OpenAlexaff
K.H.James Yeo, Jian Hua Kong, Qi Hwa Ng, Mi-Jeong Yoon, Olivia Agatha, Eunyoung Chae, Hyun O. Lee, H. Shawn Je, Young‐Jun Choe

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Medical Research CouncilNanyang Technological UniversityMinistry of Education - SingaporeDuke-NUS Medical School
Mots-clésHsp70YeastATPaseNucleusOrganismChaperone (clinical)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA-free TDP-43, resulting from mutations or post-translational modifications in its RNA-binding domain, forms multiphase condensates with Hsp70 chaperones enriched in the core. The presence of this structure in the nucleus is thought to be associated with disease states. However, the mechanisms underlying its formation remain poorly understood. In particular, it is unclear whether J-domain proteins (JDPs), critical co-chaperones of Hsp70, are incorporated into multiphase condensates, and if so, how they contribute to the phase separation process. Using yeast as a model organism with a relatively small JDP family, we identified Sis1, but not Ydj1, as an important factor in TDP-43 multiphase separation. RNA-binding-deficient TDP-43 initially forms uniform condensates enriched with the JDP Sis1 but not with Hsp70. Subsequent recruitment of Hsp70 transforms these uniform structures into multiphase condensates, with both Sis1 and Hsp70 enriched in the core. This transition requires a functional J-domain, which stimulates Hsp70 ATPase activity. These findings reveal a key role for JDPs in TDP-43 multiphase separation and highlight JDP specificity in this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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