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Enregistrement W4415458860 · doi:10.1186/s40168-025-02184-w

Host miRNAs regulate Escherichia coli O157 mucosal colonization through host-mucosa-attached microbiota interactions in calves

2025· article· en· W4415458860 sur OpenAlexafffund
Zhe Pan, Yanhong Chen, Mi Zhou, Tim A. McAllister, Tom N. McNeilly, Le Luo Guan

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBeef Cattle Research CouncilEuropean CommissionUniversity of Alberta
Mots-clésColonizationVirulenceHost (biology)PathogenVirulence factorCrosstalkEscherichia coliHost factorsMicrobiome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Host responses to pathogen colonization are central to understanding host homeostasis dynamics. Here, we used Shiga toxin (Stx)-producing Escherichia coli (STEC) O157 as an example to illustrate how pathogen colonization alters host-microbiome interactions and stimulates host responses. The STEC O157 is a critical foodborne pathogen, and cattle are the major asymptotic carrier with rectal anal junction (RAJ) being the major colonization site, leading to the transmission of this organism through the production chain. Therefore, this study leverages the multi-omics to evaluate host mechanisms to STEC O157 and to illustrate how mucosa-attached microbiome together with host miRNAs respond to the colonization of STEC O157. RESULTS: The calf model was orally challenged with E. coli O157 with and without Stx2a during the 30-day trial. Mucosa-attached microbiome analysis revealed that mucosal E. coli O157 colonization limited niche occupancy of mucosa-attached microbiota regardless of the presence or absence of Stx2a. The production of Stx2a did not induce proper local host mRNA responses but miRNA profiles were more responsive to this virulent factor during high fecal shedding. The shift of toll-like receptor (TLR) expressions together with Stx2a production possibly underlined varied miRNAome-mucosa-attached microbiota interactions. For instance, during the high fecal shedding, the increased expression of TLR2 promoted bta-miR-181b mediated host functionality, a response that was possibly blocked by Stx2a. Decreased fecal O157 shedding promoted activation of TLR4-stimulated host responses, which were coregulated by multiple miRNAs (i.e. bta-miR-146a and-184) and mucosa-attached microbes. CONCLUSION: Host mechanisms regulating STEC O157 colonization are complex interplay among mucosa-attached microbiota and host miRNAs where virulence factors could modulate such crosstalk and cause differential host responses, highlighting the importance of host-microbiome-pathogen virulence factor interactions for pathogen colonization process. Video Abstract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,239
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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