Modulation of the <i>Pseudomonas aeruginosa</i> quorum sensing cascade by MexT-regulated factors
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Pseudomonas aeruginosa (Pa ) uses quorum sensing (QS), a cell-cell communication system that enables it to sense cell density and alter gene expression. Pa has three complete QS circuits controlled by the regulators LasR, RhlR, and PqsR, which together activate the transcription of hundreds of genes. In the well-studied strain PAO1, QS is organized hierarchically, with PqsR and RhlR activity dependent on LasR. This hierarchy depends on the transcription factor MexT; deletion of mexT allows for RhlR activity in the absence of LasR. We aimed to identify how MexT modulates Pa QS architecture. We compared the transcriptome of PAO1 to that of PAO1Δ mexT and determined a MexT regulon. We identified two MexT-regulated operons that may affect the QS hierarchy: the efflux pump genes mexEF-oprN and the Pseudomonas quinolone signal (PQS) synthesis genes pqsABCDE . We tested whether the products of these genes affected the QS hierarchy. A mexEF knockout mutant, like a mexT deletion mutant, exhibited RhlR activity earlier and to a higher magnitude than wild-type PAO1. MexEF-OprN is known to export quinolones, and we found that exogenous addition of PQS also resulted in earlier and higher magnitude of RhlR activity, through PqsE, compared with wild-type PAO1. We also discovered alternate QS architectures in clinical isolates, where RhlR activity is not fully dependent on LasR. In these isolates, MexT does not influence the relationship between LasR and RhlR. Our work reveals a new suite of factors that regulate QS in Pa , with implications for bacterial behaviors in environmental and clinical settings. IMPORTANCE Bacteria interact with both abiotic and biotic factors in their environment. Quorum sensing (QS) is one mechanism that bacteria use to communicate with other bacteria and coordinate behaviors in the population. QS regulates a wide variety of processes ranging from the production of light to the modulation of virulence factors; some bacteria use single QS circuits, whereas others have several. The opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa uses QS to control some virulence functions and has three complete QS circuits. Our study explores why bacteria might have multiple QS circuits. We show how a non-QS regulated factor, MexT, influences QS regulators in P. aeruginosa, and we uncover the diversity of QS architectures in clinical isolates. These studies begin to reveal the benefits (or disadvantages) of multiple QS circuits, allowing us to understand the behaviors of bacteria that have a range of implications in health, agriculture, and bioremediation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».