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Enregistrement W4415474056 · doi:10.1128/mbio.02941-25

Modulation of the <i>Pseudomonas aeruginosa</i> quorum sensing cascade by MexT-regulated factors

2025· article· en· W4415474056 sur OpenAlexafffund
Andrew Frando, Robert S. Parsek, Marie‐Christine Groleau, Mylène Trottier, Nicole E. Smalley, Éric Déziel, Ajai A. Dandekar

Notice bibliographique

RevuemBio · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésQuorum sensingOperonTranscription factorGeneTranscription (linguistics)BiofilmTranscriptomeEffluxRegulation of gene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Pseudomonas aeruginosa (Pa ) uses quorum sensing (QS), a cell-cell communication system that enables it to sense cell density and alter gene expression. Pa has three complete QS circuits controlled by the regulators LasR, RhlR, and PqsR, which together activate the transcription of hundreds of genes. In the well-studied strain PAO1, QS is organized hierarchically, with PqsR and RhlR activity dependent on LasR. This hierarchy depends on the transcription factor MexT; deletion of mexT allows for RhlR activity in the absence of LasR. We aimed to identify how MexT modulates Pa QS architecture. We compared the transcriptome of PAO1 to that of PAO1Δ mexT and determined a MexT regulon. We identified two MexT-regulated operons that may affect the QS hierarchy: the efflux pump genes mexEF-oprN and the Pseudomonas quinolone signal (PQS) synthesis genes pqsABCDE . We tested whether the products of these genes affected the QS hierarchy. A mexEF knockout mutant, like a mexT deletion mutant, exhibited RhlR activity earlier and to a higher magnitude than wild-type PAO1. MexEF-OprN is known to export quinolones, and we found that exogenous addition of PQS also resulted in earlier and higher magnitude of RhlR activity, through PqsE, compared with wild-type PAO1. We also discovered alternate QS architectures in clinical isolates, where RhlR activity is not fully dependent on LasR. In these isolates, MexT does not influence the relationship between LasR and RhlR. Our work reveals a new suite of factors that regulate QS in Pa , with implications for bacterial behaviors in environmental and clinical settings. IMPORTANCE Bacteria interact with both abiotic and biotic factors in their environment. Quorum sensing (QS) is one mechanism that bacteria use to communicate with other bacteria and coordinate behaviors in the population. QS regulates a wide variety of processes ranging from the production of light to the modulation of virulence factors; some bacteria use single QS circuits, whereas others have several. The opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa uses QS to control some virulence functions and has three complete QS circuits. Our study explores why bacteria might have multiple QS circuits. We show how a non-QS regulated factor, MexT, influences QS regulators in P. aeruginosa, and we uncover the diversity of QS architectures in clinical isolates. These studies begin to reveal the benefits (or disadvantages) of multiple QS circuits, allowing us to understand the behaviors of bacteria that have a range of implications in health, agriculture, and bioremediation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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