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Enregistrement W4415513577 · doi:10.5376/tgg.2025.16.0015

Spatiotemporal Transcriptome Atlas of Wheat Grain Filling Stage

2025· article· W4415513577 sur OpenAlexvenueno aff
X. T. Feng

Notice bibliographique

RevueTriticeae Genomics and Genetics · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeGeneGene expressionRNA-SeqRegulation of gene expressionTranscription factorGene regulatory networkGrain yieldGene expression profiling

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The grain-filling period is a crucial stage that determines the yield and quality formation of wheat grains, involving a complex spatio-temporal regulation process. To gain a deeper understanding of the dynamic changes in gene expression and their molecular mechanisms during grain development, this study, based on multiple time points and multiple tissues, constructed a spatio-temporal transcriptome map of wheat grains covering the entire grain-filling period. Three key periods - early, middle, and late grain-filling - were selected, and the main tissues such as endosperm, embryo, and aleurone layer were collected respectively. High-quality transcriptome data were obtained by using high-throughput RNA sequencing technology. Through differential expression analysis, time series clustering, tissue-specific expression analysis and functional annotation, a large number of key genes and transcription factors related to carbon and nitrogen metabolism, starch synthesis, hormone regulation, stress resistance response, etc. were identified. This study also constructed multiple regulatory networks closely related to grain development and revealed the potential roles of non-coding Rnas and epigenetic factors in regulation, providing resource support for the analysis of the complex regulatory networks of grain development. This research will lay a solid foundation for the improvement of wheat quality, molecular breeding and the functional study of key regulatory genes during the grain-filling period.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,416
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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