Circular RNAs as Molecular Sponges Modulating miRNA Activity in Cotton
Notice bibliographique
Résumé
Circular RNAs (circRNAs) are a unique class of noncoding RNAs with covalently closed loop structures that play a crucial role in gene regulation in eukaryotes. In cotton ( Gossypium spp.), microRNAs (miRNAs) are central to posttranscriptional gene regulation, influencing growth, development, and stress responses. This study investigates the role of circRNAs as molecular sponges in regulating miRNA activity in cotton. We first describe the biogenesis of circRNAs, their structural classification, and key features such as stability and tissue-specific expression. We then examine in detail the mechanisms by which circRNAs sequester miRNAs, including a competing endogenous RNA (ceRNA) network framework and experimental approaches to validate their sponging activity. We then highlight the regulatory roles of circRNAs in cotton fiber development, stress adaptation, and defense signaling through the circRNA-miRNA-mRNA axis. This study also reviews the progress in circRNA discovery using high-throughput sequencing and computational methods, as well as the challenges faced in their annotation. A key case study illustrates how specific circular RNAs act as "sponges" for miR156 and miR828, regulating SPL transcription factors and influencing fiber phenotype. Finally, we explore the potential of circular RNAs as biotechnological tools and molecular targets in cotton breeding programs. This study highlights the potential of circular RNA research for improving cotton quality and stress tolerance while also identifying knowledge gaps and future directions for multi-omics integration and genome editing strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».