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Enregistrement W4415513759 · doi:10.5376/cgg.2025.16.0024

High-Throughput Genotyping and Its Role in Accelerating Cotton Breeding

2025· article· W4415513759 sur OpenAlexvenueno aff
Jiayi Wu, Yuxin Zhu

Notice bibliographique

RevueCotton Genomics and Genetics · 2025
Typearticle
Langue
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueResearch in Cotton Cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteomicsFiberGeneGene expressionMutantHeat shock proteinProteomeTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cotton fibers are important natural textile raw materials, and their maturation process directly affects the length, strength and quality of the fibers. However, the molecular regulatory mechanisms during the fiber maturation period remain unclear, which limits the genetic improvement of high-quality cotton varieties. To deeply reveal the protein regulatory network related to fiber maturation, in this study, Label-Free Quantitative Proteomics technology was adopted to systematically analyze the protein expression profiles in cotton fibers at different developmental stages. Further functional enrichment and protein-protein interaction network analysis indicated that cellulose synthase (CESA), sucrose synthase (SUS), peroxidase, heat shock protein, etc. play a core role in the process of fiber maturation. This study systematically analyzed the developmental biological basis of cotton fiber maturation, the types and expression characteristics of key enzymes, and verified the expression patterns of key genes through case studies. Finally, it explored the application potential of proteomics data in breeding. This research not only enriches the understanding of the maturation mechanism of cotton fibers, but also provides potential functional gene resources for molecular breeding of high-quality cotton.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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